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Enregistrement W4294550826 · doi:10.1016/j.isci.2022.105056

Human alpha cell transcriptomic signatures of types 1 and 2 diabetes highlight disease-specific dysfunction pathways

2022· article· en· W4294550826 sur OpenAlex
Emanuele Bosi, Piero Marchetti, Guy A. Rutter, Décio L. Eizirik

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueiScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMedical Research CouncilFonds De La Recherche Scientifique - FNRSEuropean CommissionWalloon excellence in life sciences and biotechnologyInnovirisWaalse GewestDiabetes FondsHuman Islet Research NetworkRégion de Bruxelles-CapitaleEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsUniversity of PennsylvaniaStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationGouvernement WallonHORIZON EUROPE Framework ProgrammeWellcome TrustLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust
Mots-clésTranscriptomeBiologyAlpha cellGeneCell biologyCell typeAlpha (finance)Gene expressionCellBeta cellGeneticsEndocrinologyDiabetes mellitusIsletMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although glucagon secretion is perturbed in both T1D and T2D, the pathophysiological changes in individual pancreatic alpha cells are still obscure. Using recently curated single-cell RNASeq data from T1D or T2D donors and their controls, we identified alpha cell transcriptomic alterations consistent with both common and discrete pathways. Although alterations in alpha cell identity gene (ARX, MAFB) expression were conserved, cytokine-regulated genes and genes involved in glucagon biosynthesis and processing were up-regulated in T1D. Conversely, mitochondrial genes associated with ROS (COX7B, NQO2) were dysregulated in T2D. Additionally, T1D alpha cells displayed altered expression of autoimmune-induced ER stress genes (ERLEC1, HSP90), whilst those from T2D subjects showed modified glycolytic and citrate cycle gene (LDHA?, PDHB, PDK4) expression. Thus, despite conserved alterations related to loss of function, alpha cells display disease-specific gene signatures which may be secondary to the main pathogenic events in each disease, namely immune- or metabolism-mediated-stress, in T1D and T2D, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,683
Score d'incertitude au seuil0,674

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle