MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4294626627 · doi:10.1111/nph.18457

The <scp>CC–NB–LRR</scp> protein <scp>BSR1</scp> from <i>Brachypodium</i> confers resistance to <i>Barley stripe mosaic virus</i> in gramineous plants by recognising <scp>TGB1</scp> movement protein

2022· article· en· W4294626627 sur OpenAlexaff
Qiuhong Wu, Yu Cui, Xuejiao Jin, Guoxin Wang, Lijie Yan, Chenchen Zhong, Meihua Yu, Wenli Li, Yong Wang, Ling Wang, Hao Wang, Chen Dang, Xinyu Zhang, Yongxing Chen, Panpan Zhang, Xiaofei Zhao, Jiajie Wu, Daolin Fu, Lanqin Xia, Eviatar Nevo, John P. Vogel, Naxin Huo, Dawei Li, Yong Gu, Andrew O. Jackson, Yongliang Zhang, Zhiyong Liu

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensInstitute of Genetics
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBrachypodium distachyonBiologyBrachypodiumGenePlant disease resistanceGeneticsLeucine-rich repeatGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Although some nucleotide binding, leucine‐rich repeat immune receptor (NLR) proteins conferring resistance to specific viruses have been identified in dicot plants, NLR proteins involved in viral resistance have not been described in monocots. We have used map‐based cloning to isolate the CC‐NB‐LRR (CNL) Barley stripe mosaic virus (BSMV) resistance gene barley stripe resistance 1 ( BSR1 ) from Brachypodium distachyon Bd3‐1 inbred line. Stable BSR1 transgenic Brachypodium line Bd21‐3, barley (Golden Promise) and wheat (Kenong 199) plants developed resistance against BSMV ND18 strain. Allelic variation analyses indicated that BSR1 is present in several Brachypodium accessions collected from countries in the Middle East. Protein domain swaps revealed that the intact LRR domain and the C‐terminus of BSR1 are required for resistance. BSR1 interacts with the BSMV ND18 TGB1 protein in planta and shows temperature‐sensitive antiviral resistance. The R 390 and T 392 residues of TGB1 ND (ND18 strain) and the G 196 and K 197 residues within the BSR1 P‐loop motif are key amino acids required for immune activation. BSR1 is the first cloned virus resistance gene encoding a typical CNL protein in monocots, highlighting the utility of the Brachypodium model for isolation and analysis of agronomically important genes for crop improvement.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,380
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNew PhytologistMême sujetPlant Virus Research StudiesTravaux en français237 207