Abstract 28 Comparative Analysis of the Cord Blood Bank in Quebec
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction In the context of the regional diversity observed in the population of Quebec, the Héma-Québec Cord Blood Bank (HQ CBB) representation differs from that of the Héma-Québec Stem Cell Registry (HQ Registry). The Bank encourages registrants of non-European descent to promote diversity, and only collects from health centers around Montreal and Quebec cities because of proximity concerns. Objective In this study, we aimed to analyze allele frequencies in the HQ CBB to assess similarities and differences in reference to the HQ Registry. Methods The HQ Registry was previously typed using high-resolution genotyping. For the HQ CBB, ambiguous two-field HLA-A, -B, -C, and -DRB1 typing data were obtained from cord blood units. Statistical analyses were performed using the GENE[RATE] population analysis tools to estimate allele and haplotype frequencies by administrative region determined by registered postal codes. Hardy-Weinberg equilibrium was verified by the nested likelihood procedure. Finally, genetic distance was compared between the HQ Registry and the HQ CBB by region using Non-metric Multi-dimensional Scaling (NMDS). Results Because of the small sample size in certain regions, HLA frequency was analyzed for 7 of the 17 regions within the HQ CBB with typings from 11,472 cord blood units. The HLA allele frequencies were previously assessed for the Registry, with 3,806 donors originating from 14 administrative regions. The Hardy-Weinberg equilibrium was rejected at least in relation to one locus in 3 regions (Capitale-Nationale, Montreal, and Laval), which differs from the results obtained from the Registry, in which the equilibrium was rejected only for Montreal. As in the Registry, allele frequencies in the HQ CBB varied by region but had limited overlap with the HQ Registry. Two regions (Chaudière-Appalaches and Laval) demonstrated significant differences in allele frequencies as represented in the HQ Registry versus the HQ CBB. Discussion We observed differences in the Quebec population representation between the HQ CBB and the HQ Registry. This probably represents selection bias related to recruitment strategies and inclusion criteria. Importantly, the complementarity of these two stem cell sources could allow for a more diverse donor pool, and this understanding could also guide the recruitment strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».