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Enregistrement W4294842694 · doi:10.1101/2022.08.31.506085

<i>Pten</i> regulates endocytic trafficking of cell adhesion and signaling molecules to pattern the retina

2022· preprint· en· W4294842694 sur OpenAlexafffund
Yacine Touahri, Joseph Hanna, Nobuhiko Tachibana, Luke Ajay David, Thomas Olender, Satoshi Okawa, Vorapin Chinchalongporn, Anjali Balakrishnan, Robert Cantrup, Rajiv Dixit, Pierre Mattar, Fermisk Saleh, Yaroslav Ilnytskyy, Monzur Murshed, Paul E. Mains, Igor Kovalchuk, Julie L. Lefebvre, Michel Cayouette, Antonio del Sol, Marjorie Brand, Benjamin E. Reese, Carol Schuurmans

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenMontreal Clinical Research InstituteUniversity of LethbridgeOttawa HospitalUniversity of OttawaMcGill UniversityUniversity of CalgaryUniversity of TorontoAlberta Children's HospitalMcGill University Health CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity of Calgary
Mots-clésCell biologyBiologyPTENEndocytic cycleRetinaSignal transductionCellEndocytosisNeurosciencePI3K/AKT/mTOR pathwayGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY The retina is an exquisitely patterned tissue, with neuronal somata positioned at regular intervals to completely sample the visual field. Cholinergic amacrine cells are spectacular exemplars of precision, distributing in two radial layers and tangentially, forming regular mosaics. Here, we investigated how the intracellular phosphatase Pten and the cell adhesion molecule Dscam cooperate to regulate amacrine cell patterning. Using double mutants to test epistasis, we found that Pten and Dscam function in parallel pathways to regulate amacrine cell positioning. Mechanistically, Pten regulates endocytic remodeling of cell adhesion molecules (Dscam, Megf10, Fat3), which are aberrantly redistributed in Pten conditional-knock-out (cKO) amacrine cells. Furthermore, extracellular vesicles derived from multivesicular endosomes have altered proteomes in Pten cKO retinas. Consequently, Wnt signaling is elevated in Pten cKO retinal amacrine cells, the pharmacological disruption of which phenocopies Pten cKO patterning defects. Pten thus controls endocytic trafficking of critical cell adhesion/signaling molecules to control amacrine cell spacing. HIGHLIGHTS Pten and Dscam act in parallel pathways to regulate amacrine cell spacing Endocytic remodeling of cell adhesion molecules is perturbed in Pten cKO retinas Extracellular vesicle content is altered in Pten cKO retinas Perturbation of Wnt signaling phenocopies defects in amacrine cell positioning eTOC BLURB Patterns in nature range from stereotyped distributions of colored patches on butterfly wings to precise neuronal spacing in the nervous system. Waddington proposed that built-in constraints canalize developmental patterns. Touahri et al . identified Pten -mediated endocytic trafficking of cell adhesion/signaling molecules as a novel constraint measure controlling retinal amacrine cell patterning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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