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Enregistrement W4294878365 · doi:10.1266/ggs.21-00137

Construction of a massive genetic resource by transcriptome sequencing and genetic characterization of <i>Megasyllis nipponica</i> (Annelida: Syllidae)

2022· article· en· W4294878365 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenes & Genetic Systems · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute for Basic BiologyInstitute of GeneticsJapan Science SocietyHokkaido UniversityMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésBiologyEvolutionary developmental biologyTranscriptomeEvolutionary biologyMorphogenesisGenomeGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the processes and consequences of the morphological diversity of organisms is one of the major goals of evolutionary biology. Studies on the evolution of developmental mechanisms of morphologies, or evo-devo, have been extensively conducted in many taxa and have revealed many interesting phenomena at the molecular level. However, many other taxa exhibiting intriguing morphological diversity remain unexplored in the field of evo-devo. Although the annelid family Syllidae shows spectacular diversity in morphological development associated with reproduction, its evo-devo study, especially on molecular development, has progressed slowly. In this study, we focused on Megasyllis nipponica as a new model species for evo-devo in syllids and performed transcriptome sequencing to develop a massive genetic resource, which will be useful for future molecular studies. From the transcriptome data, we identified candidate genes that are likely involved in morphogenesis, including genes involved in hormone regulation, sex determination and appendage development. Furthermore, a computational analysis of the transcriptome sequence data indicated the occurrence of DNA methylation in coding regions of the M. nipponica genome. In addition, flow cytometry analysis showed that the genome size of M. nipponica was approximately 524 megabases. These results facilitate the study of morphogenesis in molecular terms and contribute to our understanding of the morphological diversity in syllids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,470
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle