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Enregistrement W4294990794 · doi:10.1371/journal.pcbi.1010461

Constructing functional models from biophysically-detailed neurons

2022· article· en· W4294990794 sur OpenAlexafffund
Peter Duggins, Chris Eliasmith

Notice bibliographique

RevuePLoS Computational Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Memory and Neural Computing
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAir Force Office of Scientific ResearchOntario Innovation Trust
Mots-clésComputer scienceForgettingArtificial neural networkNeuroscienceArtificial intelligenceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Improving biological plausibility and functional capacity are two important goals for brain models that connect low-level neural details to high-level behavioral phenomena. We develop a method called "oracle-supervised Neural Engineering Framework" (osNEF) to train biologically-detailed spiking neural networks that realize a variety of cognitively-relevant dynamical systems. Specifically, we train networks to perform computations that are commonly found in cognitive systems (communication, multiplication, harmonic oscillation, and gated working memory) using four distinct neuron models (leaky-integrate-and-fire neurons, Izhikevich neurons, 4-dimensional nonlinear point neurons, and 4-compartment, 6-ion-channel layer-V pyramidal cell reconstructions) connected with various synaptic models (current-based synapses, conductance-based synapses, and voltage-gated synapses). We show that osNEF networks exhibit the target dynamics by accounting for nonlinearities present within the neuron models: performance is comparable across all four systems and all four neuron models, with variance proportional to task and neuron model complexity. We also apply osNEF to build a model of working memory that performs a delayed response task using a combination of pyramidal cells and inhibitory interneurons connected with NMDA and GABA synapses. The baseline performance and forgetting rate of the model are consistent with animal data from delayed match-to-sample tasks (DMTST): we observe a baseline performance of 95% and exponential forgetting with time constant τ = 8.5s, while a recent meta-analysis of DMTST performance across species observed baseline performances of 58 - 99% and exponential forgetting with time constants of τ = 2.4 - 71s. These results demonstrate that osNEF can train functional brain models using biologically-detailed components and open new avenues for investigating the relationship between biophysical mechanisms and functional capabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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