Microarray-guided evaluation of the frequency, B-cell origins, and selectivity of human glycan-binding antibodies reveals new insights and novel antibodies
Notice bibliographique
Résumé
The immune system produces a diverse collection of antiglycan antibodies that are critical for host defense. At present, however, we know very little about the binding properties, origins, and sequences of these antibodies because of a lack of access to a variety of defined individual antibodies. To address this challenge, we used a glycan microarray with over 800 different components to screen a panel of 516 human monoclonal antibodies that had been randomly cloned from different B-cell subsets originating from healthy human subjects. We obtained 26 antiglycan antibodies, most of which bound microbial carbohydrates. The majority of the antiglycan antibodies identified in the screen displayed selective binding for specific glycan motifs on our array and lacked polyreactivity. We found that antiglycan antibodies were about twice as likely than expected to originate from IgG + memory B cells, whereas none were isolated from naïve, early emigrant, or immature B cells. Therefore, our results indicate that certain B-cell subsets in our panel are enriched in antiglycan antibodies, and IgG + memory B cells may be a promising source of such antibodies. Furthermore, some of the newly identified antibodies bound glycans for which there are no reported monoclonal antibodies available, and these may be useful as research tools, diagnostics, or therapeutic agents. Overall, the results provide insight into the types and properties of antiglycan antibodies produced by the human immune system and a framework for the identification of novel antiglycan antibodies in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».