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Enregistrement W4295122575 · doi:10.3390/bioengineering9090448

Polymorphisms of the IL-17A Gene Influence Milk Production Traits and Somatic Cell Score in Chinese Holstein Cows

2022· article· en· W4295122575 sur OpenAlexaff
Sahar Ghulam Mohyuddin, Yan Liang, Wei Ni, Abdelaziz Adam Idriss Arbab, Huiming Zhang, Mingxun Li, Zhangping Yang, Niel A. Karrow, Yongjiang Mao

Notice bibliographique

RevueBioengineering · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMilk Quality and Mastitis in Dairy Cows
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesGovernment of Jiangsu ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismSomatic cell countBiologyMastitisGenotypingLinkage disequilibriumSNPSomatic cellHolstein CattleDairy cattleGeneSNP genotypingGeneticsAnimal scienceGenotypeLactationIce calvingPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cow’s milk production characteristics are a significant economic indicator in the livestock industry. Serum cytokines such as interleukin-17 (IL-17) may be potential indicators for bovine mastitis concerning the milk somatic cell count (SCC) and somatic cell score (SCS). The current study aims to find previously undiscovered single nucleotide polymorphisms in the bovine (IL-17A) gene and further investigates their associations with milk production traits in Chinese Holstein cows. Twenty Chinese Holstein cows were randomly chosen from six farms in Jiangsu Province, China. The DNA was extracted from selected samples of bloods for PCR amplification Sequence analyses were used to find SNPs in the bovine (IL-17A) gene. The discovered five SNPs are g-1578A>G, g-1835G>A, and g-398T>A in the 5′UTR; g3164T>C and g3409G>C in the exon region. The genotyping of Holstein cows (n = 992) was performed based on Sequenom Mass ARRAY and SNP data. The connection between SNPs, milk production variables, and the somatic cell score was investigated using the least-squares method. Based on the results, SNP g-398T>A had a significant linkage disequilibrium with g3164T>C. SNPs were found to have significant (p < 0.05) correlations with the test-day milk yield. In conclusion, IL-17A affects cow’s milk production traits significantly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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