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Enregistrement W4295441597 · doi:10.1159/000526212

Associations between <b><i>TNFAIP3</i></b> Polymorphisms and Rheumatoid Arthritis: A Systematic Review and Meta-Analysis Update with Trial Sequential Analysis

2022· review· en· W4295441597 sur OpenAlexaboutno aff
Young Ho Lee

Notice bibliographique

RevuePublic Health Genomics · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisMedicineOdds ratioInternal medicineRheumatoid arthritisConfidence intervalSubgroup analysisAlleleOncologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The tumor necrosis factor alpha inducible protein 3 (TNFAIP3) gene produces ubiquitin-editing protein A20, which inhibits nuclear factor-κB (NF-κB) activation in a variety of signaling pathways. We examined the association between TNFAIP3 polymorphisms and rheumatoid arthritis (RA) susceptibility. METHODS: MEDLINE, Embase, Scopus, and Web of Science were searched for available articles on TNFAIP3 polymorphisms in RA patients from inception until July 11, 2022. We included case-control studies on the association between rs2230926 and rs5029937 polymorphisms of TNFAIP3 and RA, and we excluded studies that contained overlapping data. We scored the quality of each study included based on the Newcastle-Ottawa Scale. Meta-analyses evaluated the association between TNFAIP3 polymorphisms and RA susceptibility in diverse ethnic populations and was verified through trial sequential analysis (TSA). This meta-analysis was registered in the PROSPERO register (number: CRD42022345160). There was no funding source. RESULTS: Seventeen studies were chosen for meta-analysis. Ten studies for rs2230926, and seven for rs5029937. An association was noted between TNFAIP3 rs2230926 G allele and RA in all subjects (odds ratio [OR] = 1.389; 95% confidence interval [CI] = 1.161-1.662; p < 0.001). Ethnicity-specific analysis showed significant association of rs2230926 G allele with RA in Europeans and Asians (OR = 1.642; 95% CI = 1.099-2.452; p = 0.015; OR = 1.404; 95% CI = 1.262-1.562; p < 0.001). An association was also noted between TNFAIP3 rs5029937 T allele and RA in all subjects (OR = 1.389; 95% CI = 1.207-1.785; p < 0.001). An ethnicity-specific meta-analysis revealed a significant association of the rs5029937 T allele with RA in Europeans and Asians. Dominant model analysis showed the same pattern for TNFAIP3 rs2230926 G and rs5029937 T alleles in Europeans and Asians, suggesting an association between rs2230926 G and rs5029937. TSA indicated a robust association between the TNFAIP3 polymorphisms and the risk of RA. CONCLUSION: TNFAIP3 rs2230926 and rs5029937 polymorphisms are associated with RA susceptibility in European and Asian populations. However, the data were not stratified by parameters such as rheumatoid factor status, disease activity, or environmental variables.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,657
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,004
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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