Zipper‐Interacting Protein Kinase: Inferring Function In Smooth Muscle Contractility By Identifying Bona Fide Substrates
Notice bibliographique
Résumé
Zipper‐interacting protein kinase (ZIPK) has been implicated in Ca 2+ ‐independent smooth muscle contraction, although its specific role is unknown. To understand the role of ZIPK in smooth muscle contractility, we set out to identify bona fide ZIPK substrates, using a technique that takes advantage of ‘bulky’ ATP analogues (modified at the N 6 position) and a bioengineered ZIPK capable of utilizing such substrates. Conserved amino acid residues in ZIPK that come into close contact with the N 6 region of ATP were identified and mutated. To identify substrates, 32 P‐labeled 6‐Phe‐ATP and ZIPK L93G protein were added to permeabilized rat caudal arterial smooth muscle strips. 32 P‐labelled substrate proteins were detected by autoradiography and phosphorimaging following SDS‐PAGE. Mass spectrometry was employed to identify ZIPK substrates and LC 20 was confirmed as a direct target. Two other substrates (18 kDa and 40 kDa) were also detected. Experiments were also carried out with rat caudal arterial smooth muscle in the absence of endogenous ATP, but supplemented with 6‐Phe‐ATP and ZIPK L93G, and putative ZIPK substrates identified by western blotting with phosphospecific antibodies. LC 20 was confirmed as a direct target of ZIPK by this method; however no phosphorylation of MYPT1 was detected. We conclude that ZIPK is involved in regulation of smooth muscle contraction through direct phosphorylation of LC 20 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».