MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4295592338 · doi:10.3390/diagnostics12092191

The Use of Optical Coherence Tomography for Gross Examination and Sampling of Fixed Breast Specimens: A Pilot Study

2022· article· en· W4295592338 sur OpenAlexaff
Hala Faragalla, Bahar Davoudi, Naama Nofech-Moses, Yeni Yucel, Kiran Jakate

Notice bibliographique

RevueDiagnostics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueOptical Coherence Tomography Applications
Établissements canadiensToronto Metropolitan UniversitySt. Michael's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOptical coherence tomographyDuctal carcinomaHistopathologyGross examinationMalignancyMedicineBreast cancerPathologyHistologyRadiologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thorough gross examination of breast cancer specimens is critical in order to sample relevant portions for subsequent microscopic examination. This task would benefit from an imaging tool which permits targeted and accurate block selection. Optical coherence tomography (OCT) is a non-destructive imaging technique that visualizes tissue architecture and has the potential to be an adjunct at the gross bench. Our objectives were: (1) to familiarize pathologists with the appearance of breast tissue entities on OCT; and (2) to evaluate the yield and quality of OCT images of unprocessed, formalin-fixed breast specimens for the purpose of learning and establishment of an OCT-histopathology library. METHODS: Firstly, 175 samples from 40 formalin-fixed, unprocessed breast specimens with residual tissue after final diagnosis were imaged with OCT and then processed into histology slides. Histology findings were correlated with features on OCT. RESULTS: Residual malignancy was seen in 30% of tissue samples. Corresponding OCT images demonstrated that tumor can be differentiated from fibrous stroma, based on features such as irregular boundary, heterogeneous texture and reduced penetration depth. Ductal carcinoma in situ can be subtle, and it is made more recognizable by the presence of comedo necrosis and calcifications. OCT features of benign and malignant breast entities were compiled in a granular but user-friendly reference tool. CONCLUSION: OCT images of fixed breast tissue were of sufficient quality to reproduce features of breast entities previously described in fresh tissue specimens. Our findings support the use of readily available unprocessed, fixed breast specimens for the establishment of an OCT-histopathology library.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDiagnosticsMême sujetOptical Coherence Tomography ApplicationsTravaux en français237 207