Abstract 070: ONE UP-REGULATED NOVEL MICRORNA AND 4 DOWN-REGULATED MRNA TARGETS WERE IDENTIFIED IN PERIPHERAL BLOOD MONONUCLEAR CELLS OF HYPERTENSIVE PATIENTS WITH METABOLIC SYNDROME
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Hypertension is associated with target organ damage such as kidney injury. The immune system plays a role in hypertension and target organ damage. Activation of T cells has been reported among peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of patients with HTN. MicroRNAs are crucial post-transcriptional regulators of immune cell development and function. Hypothesis: MicroRNAs play a role in the activation of immune cells in hypertension with target organ damage in humans. Methods: Normotensive subjects (NTN) and patients with hypertension (HTN) associated or not with at least 2 other features of the metabolic syndrome (MetS) or chronic kidney disease (CKD) were studied (n=15-16). PBMCs were isolated from blood, RNA extracted, small and total RNA sequencing (RNA-seq) using an Illumina HiSeq-2500 and data were analyzed using a systems biology approach. Differentially expressed (DE) microRNAs and mRNAs were identified with fold change (FC) >2 and >1.5, respectively, and P <0.005. DE miRNAs with RNA-seq count number (CN) >500, and predicted targets by TargetScan with CN>300 were validated by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) in PBMCs. Results: RNA-seq identified DE microRNAs and mRNAs in HTN (22 and 19), MetS (57 and 401) and CKD (6 and 26) compared to NTN. RT-qPCR validated a novel miRNA (miR-pl-86 [2-fold up]) and 4 predicted mRNA targets (WD repeat domain 89 [ WDR89 , 51% down], Dmx like 1 [ DMXL1 , 52% down], zinc finger protein 600 [ ZNF600 , 63% down] and NOC3 like DNA replication regulator [ NOC3L , 61% down]) in MetS vs NTN ( P <0.05). RNA-seq results were correlated with RT-qPCR data for miR-pl-86 (R 2 =0.37, P <5.5E-07, n=56) , WDR89 (R 2 =0.29, P <1.4E-05, n=57) , DMXL1 (R 2 =0.33, P <2.7E-06, n=57) , ZNF600 (R 2 =0.25, P <7.9E-05, n=57) , and NOC3L (R 2 =0.27, P <3.5E-05, n=57). Conclusion: This study identified one up-regulated novel microRNA and 4 down-regulated mRNA targets in PBMCs of patients with HTN and MetS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».