Subcellular distribution of PP1 isoforms in holoenzyme complexes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Unlike its counterpart Ser/Thr kinases, the predominant Ser/Thr protein phosphatase 1 (PP1) is a promiscuous enzyme that gains its subcellular localization and substrate specificity from a large panel of regulatory proteins with which it associates in predominantly dimeric complexes. Inhibition of specific PP1-mediated dephosphorylation events relies on targeting the regulatory rather than the catalytic subunit, which in turn relies on a comprehensive understanding of the holoenzyme complexes that underlie its distribution throughout the cell. Proteomic, bioinformatic and biochemical screens have assembled lists of putative regulatory proteins, which have been studied to varying degrees. We took a non-biased approach to link steady-state localization to complexes, using a combination of fluorescence imaging, cellular fractionation and quantitative affinity purification/mass spectrometry (AP/MS) to map interactomes for PP1ɑ/β/ɣ in 3 human cell lines. Comparing the distribution of each isoform between the pool of identified regulatory subunits highlighted key signaling pathways and identified c20orf27 as a novel PP1 regulatory protein. Steady-state association of a large fraction of PP1 with the evolutionarily conserved SDS22 was demonstrated, as was redistribution at the entry to mitosis. This is consistent with recent work suggesting that SDS22 acts as a PP1 sink from which it can be recruited as needed. Moving forward, this approach can be used to assess the redistribution of PP1 during other cellular processes or in response to perturbations or disease states, facilitating identification of the relevant complexes and the design of strategies to target them therapeutically.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».