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Enregistrement W4296023671 · doi:10.1093/humrep/deac189

Standards in semen examination: publishing reproducible and reliable data based on high-quality methodology

2022· article· en· W4296023671 sur OpenAlexaff
Lars Björndahl, Christopher L. R. Barratt, David Mortimer, Ashok Agarwal, R. John Aitken, Juan G. Álvarez, Natalie Aneck-Hahn, Stefan Arver, Elisabetta Baldi, Lluís Bassas, Florence Boitrelle, Riana Bornman, Douglas T. Carrell, José Antonio Castilla, Gerardo Cerezo Parra, J.H. Check, Patricia S. Cuasnicú, Sally D. Perreault, C. de Jager, Christopher J. De Jonge, Joël R. Drevet, Erma Z. Drobnis, Stefan S. du Plessis, Michael L. Eisenberg, Sandro C. Esteves, Evangelini Evgeni, Alberto Ferlin, Nicolás Garrido, Aleksander Giwercman, I Goovaerts, Trine B. Haugen, Ralf Henkel, Lars Henningsohn, Marie‐Claude Hofmann, James M. Hotaling, Piotr Jędrzejczak, Pierre Jouannet, Niels Jørgensen, Jackson Kirkman‐Brown, Csilla Krausz, Maciej Kurpisz, Ulrik Kvist, Dolores J. Lamb, Hagai Levine, Kate L. Loveland, Robert I. McLachlan, Ali Mahran, Liana Maree, Sarah Martins da Silva, Michael T. Mbizvo, Andreas Meinhardt, Roelof Menkveld, Sharon T. Mortimer, Sergey I. Moskovtsev, Charles Müller, María José Munuce, Monica Muratori, Craig Niederberger, Cristián O’Flaherty, Rafael Oliva, Willem Ombelet, Allan Pacey, Michael A. Palladino, Ranjith Ramasamy, Liliana Ramos, Nathalie Rives, Eduardo R. S. Roldán, Susan Rothmann, Denny Sakkas, Andrea Salonia, María Cristina Sánchez-Pozo, Rossana Sapiro, Stefan Schlatt, Peter N. Schlegel, Hans-Christian Schuppe, Rupin Shah, Niels E. Skakkebæk, Katja J. Teerds, Igor Toskin, Herman Tournaye, Paul J. Turek, Gerhard van der Horst, Mónica H. Vazquez‐Levin, Christina Wang, A.M.M. Wetzels, Theodosia Zeginiadou, Armand Zini

Notice bibliographique

RevueHuman Reproduction · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensSt Mary's Hospital CentreUniversity of TorontoMcGill UniversityCReATe Fertility CentreUniversity of British ColumbiaAchieve Life Sciences (Canada)
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentWorld Health Organization
Mots-clésChecklistTransparency (behavior)PublishingSemenComputer scienceLibrary scienceMedicineMedical physicsMedical educationPsychologyPolitical scienceLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biomedical science is rapidly developing in terms of more transparency, openness and reproducibility of scientific publications. This is even more important for all studies that are based on results from basic semen examination. Recently two concordant documents have been published: the 6th edition of the WHO Laboratory Manual for the Examination and Processing of Human Semen, and the International Standard ISO 23162:2021. With these tools, we propose that authors should be instructed to follow these laboratory methods in order to publish studies in peer-reviewed journals, preferable by using a checklist as suggested in an Appendix to this article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,231
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,343
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,769
Score d'incertitude au seuil0,948

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2310,343
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0150,014
Études des sciences et des technologies0,0030,008
Communication savante0,0130,008
Science ouverte0,0060,009
Intégrité de la recherche0,0050,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,260
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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