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Enregistrement W4296026431 · doi:10.1186/s13023-022-02512-5

Outcomes of mitochondrial long chain fatty acid oxidation and carnitine defects from a single center metabolic genetics clinic

2022· review· en· W4296026431 sur OpenAlexafffund
Anastasia Ambrose, Melissa Sheehan, Shalini Bahl, Taryn Athey, Shailly Ghai-Jain, Alicia Chan, Saadet Mercimek‐Andrews

Notice bibliographique

RevueOrphanet Journal of Rare Diseases · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNorthern Alberta Clinical Trials and Research CentreUltragenyx PharmaceuticalAlberta Health Services
Mots-clésCarnitineBeta oxidationFatty acid metabolismGenotypeInternal medicineBiologyMedicineGastroenterologyPhenotypeFatty acidCarnitine O-palmitoyltransferaseHuman geneticsMetabolismEndocrinologyGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Mitochondrial long-chain fatty acid oxidation and carnitine metabolism defects are a group of inherited metabolic diseases. We performed a retrospective cohort study to report on the phenotypic and genotypic spectrum of mitochondrial long-chain fatty acid oxidation and carnitine metabolism defects as well as their treatment outcomes. METHODS: All patients with mitochondrial long-chain fatty acid oxidation and carnitine metabolism defects were included. We divided patients into two groups to compare outcomes of those treated symptomatically (SymX) and asymptomatically (AsymX). We reviewed patient charts for clinical features, biochemical investigations, molecular genetic investigations, cardiac assessments, neuroimaging, treatments, and outcomes. RESULTS: There were 38 patients including VLCAD (n = 5), LCHAD (n = 4), CACT (n = 3), MAD (n = 1), CPT-I (n = 13), CPT-II (n = 3) deficiencies and CTD (n = 9). Fourteen patients were diagnosed symptomatically (SymX), and 24 patients were diagnosed asymptomatically (AsymX). Twenty-eight variants in seven genes were identified in 36 patients (pathogenic/likely pathogenic n = 25; variant of unknown significance n = 3). Four of those variants were novel. All patients with LCHAD deficiency had the common variant (p.Glu474Gln) in HADHA and their phenotype was similar to the patients reported in the literature for this genotype. Only one patient with VLCAD deficiency had the common p.Val283Ala in ACADVL. The different genotypes in the SymX and AsymX groups for VLCAD deficiency presented with similar phenotypes. Eight patients were treated with carnitine supplementation [CTD (n = 6), CPT-II (n = 1), and MAD (n = 1) deficiencies]. Thirteen patients were treated with a long-chain fat restricted diet and MCT supplementation. A statistically significant association was found between rhabdomyolysis, and hypoglycemia in the SymX group compared to the AsymX group. A higher number of hospital admissions, longer duration of hospital admissions and higher CK levels were observed in the SymX group, even though the symptomatic group was only 37% of the study cohort. CONCLUSION: Seven different mitochondrial long-chain fatty acid oxidation and carnitine metabolism defects were present in our study cohort. In our clinic, the prevalence of mitochondrial long-chain fatty acid oxidation and carnitine defects was 4.75%.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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