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Enregistrement W4296031138 · doi:10.1038/s41597-022-01682-y

An Open MRI Dataset For Multiscale Neuroscience

2022· article· en· W4296031138 sur OpenAlexafffundabout
Jessica Royer, Raúl Rodríguez‐Cruces, Shahin Tavakol, Sara Larivière, Peer Herholz, Qiongling Li, Reinder Vos de Wael, Casey Paquola, Oualid Benkarim, Bo‐yong Park, Alexander J. Lowe, Daniel S. Margulies, Jonathan Smallwood, Andrea Bernasconi, Neda Bernasconi, Birgit Frauscher, Boris C. Bernhardt

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCentre Azrieli de recherche sur l'autisme, Institut et Hôpital Neurologiques de MontréalCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Open Neuroscience PlatformHealth CanadaInstitute for Basic ScienceNational Institute of Mental HealthHospital for Sick ChildrenNational Research Foundation of KoreaInha UniversityNational Institutes of HealthSick Kids FoundationCanada First Research Excellence FundCanada Research ChairsNational Research FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitute for Information and Communications Technology PromotionGovernment of CanadaSavoy FoundationChina Scholarship CouncilMinistry of Science and ICT, South KoreaFondation Brain CanadaMcGill University
Mots-clésOpen scienceNeuroscienceData scienceNeuroinformaticsComputer sciencePsychologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multimodal neuroimaging grants a powerful window into the structure and function of the human brain at multiple scales. Recent methodological and conceptual advances have enabled investigations of the interplay between large-scale spatial trends (also referred to as gradients) in brain microstructure and connectivity, offering an integrative framework to study multiscale brain organization. Here, we share a multimodal MRI dataset for Microstructure-Informed Connectomics (MICA-MICs) acquired in 50 healthy adults (23 women; 29.54 ± 5.62 years) who underwent high-resolution T1-weighted MRI, myelin-sensitive quantitative T1 relaxometry, diffusion-weighted MRI, and resting-state functional MRI at 3 Tesla. In addition to raw anonymized MRI data, this release includes brain-wide connectomes derived from (i) resting-state functional imaging, (ii) diffusion tractography, (iii) microstructure covariance analysis, and (iv) geodesic cortical distance, gathered across multiple parcellation scales. Alongside, we share large-scale gradients estimated from each modality and parcellation scale. Our dataset will facilitate future research examining the coupling between brain microstructure, connectivity, and function. MICA-MICs is available on the Canadian Open Neuroscience Platform data portal ( https://portal.conp.ca ) and the Open Science Framework ( https://osf.io/j532r/ ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,096

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,038

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,245
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,152 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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