Clinical implementation of genetic testing in adults for hereditary hematologic malignancy syndromes
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: As research on hereditary hematologic malignancy syndromes (HHMS) are accumulating, cancer genetics clinics are identifying more adult hematology patients with an inherited component to their disease. However, investigations for HHMS are complex, and there is no formal consensus on genetic testing criteria. METHODS: We developed genetic testing criteria for adult hematology patients through a comprehensive literature review and our experience at the Princess Margaret Cancer Centre. We validated our criteria by applying them retrospectively to patients referred to our clinic for HHMS assessment. RESULTS: Our genetic testing criteria are comprehensive of myeloid malignancies, lymphoid malignancies, and bone marrow failure, including age at diagnosis, family history, and genetic test results in blood and bone marrow. Of the 104 patients who met the criteria, 26% had at least 1 actionable variant in any gene associated with an increased risk of cancer and 13% had an actionable variant resulting in an HHMS diagnosis. A total of 15 patients had incidental findings, including 11 patients with a pathogenic variant associated with carrier status for an autosomal recessive disorder and 4 patients with a mosaic result. CONCLUSION: Our high gene positivity rate shows the utility of a broad approach to germline testing in an adult hematology population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».