MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4296077873 · doi:10.1038/s41467-022-33229-5

A small molecule antagonist of SMN disrupts the interaction between SMN and RNAP II

2022· article· en· W4296077873 sur OpenAlexafffund
Yanli Liu, Aman Iqbal, Weiguo Li, Zuyao Ni, Yalong Wang, Jurupula Ramprasad, Karan Joshua Abraham, Mengmeng Zhang, Dorothy Yanling Zhao, Qin Su, P. Loppnau, Honglv Jiang, Xinghua Guo, Peter J. Brown, Xuechu Zhen, Guoqiang Xu, Karim Mekhail, Xingyue Ji, Mark T. Bedford, Jack Greenblatt, Jinrong Min

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchArgonne National LaboratoryNational Institute of General Medical SciencesOntario Genomics InstituteWestern Economic Diversification CanadaNational Research Council CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCancer Prevention and Research Institute of TexasGenentechPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsU.S. Department of EnergyNational Natural Science Foundation of ChinaGovernment of CanadaEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsNational Institutes of HealthOntario GenomicsMerck KGaAGenome CanadaNational Cancer InstituteBayerMcGill UniversityUniversity of ChicagoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerUniversity of SaskatchewanCanadian Light SourceBristol-Myers Squibb
Mots-clésSpinal muscular atrophyCas9Cell biologyBiologyTranscription (linguistics)CRISPRSmall moleculeMutagenesisChemistryComputational biologyGeneticsMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Survival of motor neuron (SMN) functions in diverse biological pathways via recognition of symmetric dimethylarginine (Rme2s) on proteins by its Tudor domain, and deficiency of SMN leads to spinal muscular atrophy. Here we report a potent and selective antagonist with a 4-iminopyridine scaffold targeting the Tudor domain of SMN. Our structural and mutagenesis studies indicate that both the aromatic ring and imino groups of compound 1 contribute to its selective binding to SMN. Various on-target engagement assays support that compound 1 specifically recognizes SMN in a cellular context and prevents the interaction of SMN with the R1810me2s of RNA polymerase II subunit POLR2A, resulting in transcription termination and R-loop accumulation mimicking SMN depletion. Thus, in addition to the antisense, RNAi and CRISPR/Cas9 techniques, potent SMN antagonists could be used as an efficient tool to understand the biological functions of SMN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,758
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetNeurogenetic and Muscular Disorders ResearchTravaux en français237 207