Abstract IA014: Stem cell and developmental hierarchies in rhabdomyosarcoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rhabdomyosarcoma (RMS) is the most common soft-tissue sarcoma of childhood and is comprised of at least two major molecular subtypes. Despite sharing features with skeletal muscle, the conservation of underlying cellular hierarchy with human muscle development and the identification of molecularly-defined tumor-propagating cells have not been reported. Using single-cell RNA sequencing of patient-derived RMS, DNA-barcode cell fate mapping, antibody enrichment and functional stem cell assays, and mouse xenograft modeling, we have uncovered tumor cell hierarchies in Fusion-negative (FN-) RMS that are shared with normal human muscle development. We also identified common developmental stages at which tumor cells become arrested. FN-RMS resemble early muscle found in embryonic and larval development, while fusion-positive (FP-) RMS express a highly specific developmental gene program found in muscle cells transiting from embryonic to fetal development at 7-7.75 weeks of age. FP-RMS also have neural-pathway enriched cell states, suggesting less-rigid adherence to muscle development hierarchies in this disease. Finally, we identify a new molecularly-defined tumor-propagating cell in FN-RMS that shares remarkable similarity to the newly described bi-potent, muscle mesenchyme stem/progenitor cell that makes both muscle and osteogenic cells. Citation Format: David M. Langenau, Yun Wei, Qian Qin, Luca Pinello. Stem cell and developmental hierarchies in rhabdomyosarcoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Sarcomas; 2022 May 9-12; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2022;28(18_Suppl):Abstract nr IA014.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».