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Enregistrement W4296167973 · doi:10.20944/preprints202207.0160.v2

NIH SenNet Consortium: Mapping Senescent Cells in the Human Body to Understand Health and Disease

2022· preprint· en· W4296167973 sur OpenAlexaff
Patty J Lee, Philip D. Blood, Katy Börner, Judith Campisi, Feng Chen, Heike E. Daldrup‐Link, Phil De Jager, Li Ding, Francesca E. Duncan, Oliver Eickelberg, Rong Fan, Toren Finkel, Vesna D. Garovic, Nils Gehlenborg, Carolyn Glass, Ziv Bar‐Joseph, Pragati Katiyar, Sojin Kim, Mélanie Königshoff, George A. Kuchel, Haesung Lee, Jun Hee Lee, Jian Ma, Qin Ma, Simon Melov, Kay Metis, Ana L. Mora, Nicolas Musi, Nicola Neretti, João F. Passos, Irfan Rahman, Juan Carlos Rivera‐Mulia, Paul Robson, Mauricio Rojas, Ananda L. Roy, Birgit Schilling, Pixu Shi, Jonathan C. Silverstein, Vidyani Suryadevera, Jichun Xie, Jinhua Wang, An-Kwok Ian Wong, Laura J. Niedernhofer

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesOffice of Strategic CoordinationNIH Office of the DirectorCommon FundNational Institutes of Health
Mots-clésLeverage (statistics)Computational biologyComputer scienceData scienceBioinformaticsMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cells respond to a myriad of stressors by senescing, acquiring stable growth arrest, morphologic and metabolic changes, and a senescence-associated-secretory-phenotype (SASP). The heterogeneity of senescent cells (SnCs) and their SASP is vast, yet poorly characterized. SnCs have diverse roles in health and disease and are therapeutically targetable, making characterization of SnCs and harmonization of their nomenclature a priority. The Cellular Senescence Network (SenNet), a NIH Common Fund initiative, will leverage emerging single cell and spatial-omics to identify and map SnCs in numerous organs across the lifespan of humans and mice. A common coordinate framework will integrate the data, using validated, standardized methods, creating public 4-dimensional SnC atlases. Key SenNet deliverables include development of innovative tools/technologies to detect SnCs, biomarker discovery, common annotations to describe SnCs and extensive public data sets. The goal is to comprehensively understand and map SnCs for diagnostic and therapeutic purposes to improve human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,323
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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