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Enregistrement W4296185636 · doi:10.1101/2022.09.16.508215

<i>Leishmania mexicana Centrin</i> Knock out Parasites Promote M1-polarizing Metabolic Changes

2022· preprint· en· W4296185636 sur OpenAlexaff
Greta Volpedo, Timur Oljuskin, Nazli Azodi, Shinjiro Hamano, Greg Matlashewski, Sreenivas Gannavaram, Hira L. Nakhasi, Abhay R. Satoskar

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPentose phosphate pathwayLeishmania mexicanaImmune systemNitric oxideLeishmaniaBiologyPhenotypeAmastigoteImmunityImmunologyMicrobiologyMetabolismParasite hostingGlycolysisBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Leishmaniasis is a tropical disease present in more than 90 countries. Presently, there is no approved vaccine for human use. We have previously developed live attenuated L. mexicana Cen −/− (LmexCen −/− ) as a vaccine candidate that showed excellent efficacy that was characterized by reduced activation of Th2 responses and enhanced Th1 responses, contrary to wild type L. mexicana (Lmex WT ) infection. Towards understanding the interplay between immune mechanisms of protection and metabolic reprogramming, we applied untargeted mass spectrometric analysis to LmexCen −/− and compared them with Lmex WT infection. Data showed that enriched pentose phosphate pathway (PPP) in ears immunized with LmexCen −/− parasites, compared to naïve and Lmex WT-infected ears. This pathway is known to promote an M1 phenotype in macrophages, suggesting a switch to a pro-inflammatory phenotype following LmexCen −/− inoculation. Accordingly, inhibition of the PPP in macrophages cultured with LmexCen −/− parasites led to diminished production of nitric oxide, IL-12, and IL-1β, hallmarks of classical activation. Overall, our study revealed novel immune regulatory mechanisms that may be critical for the induction of protective immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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