MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4296248773 · doi:10.1038/s41698-022-00307-2

An international working group consensus report for the prioritization of molecular biomarkers for Ewing sarcoma

2022· review· en· W4296248773 sur OpenAlexaff
David S. Shulman, Sarah Burkhead Whittle, Didier Surdez, Kelly M. Bailey, Enrique de Álava, Jason T. Yustein, Adam Shlien, Masanori Hayashi, Alexander J.R. Bishop, Brian D. Crompton, Steven G. DuBois, Neerav Shukla, Patrick J. Leavey, Stephen L. Lessnick, Heinrich Kovar, Olivier Delattre, Thomas G. P. Grünewald, Cristina R. Antonescu, Ryan D. Roberts, Jeffrey A. Toretsky, Franck Tirode, Richard Görlick, Katherine A. Janeway, Damon R. Reed, Elizabeth R. Lawlor, Patrick J. Grohar

Notice bibliographique

Revuenpj Precision Oncology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMedicineOncologyDiseaseSarcomaInternal medicineClinical trialEwing's sarcomaBioinformaticsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The advent of dose intensified interval compressed therapy has improved event-free survival for patients with localized Ewing sarcoma (EwS) to 78% at 5 years. However, nearly a quarter of patients with localized tumors and 60-80% of patients with metastatic tumors suffer relapse and die of disease. In addition, those who survive are often left with debilitating late effects. Clinical features aside from stage have proven inadequate to meaningfully classify patients for risk-stratified therapy. Therefore, there is a critical need to develop approaches to risk stratify patients with EwS based on molecular features. Over the past decade, new technology has enabled the study of multiple molecular biomarkers in EwS. Preliminary evidence requiring validation supports copy number changes, and loss of function mutations in tumor suppressor genes as biomarkers of outcome in EwS. Initial studies of circulating tumor DNA demonstrated that diagnostic ctDNA burden and ctDNA clearance during induction are also associated with outcome. In addition, fusion partner should be a pre-requisite for enrollment on EwS clinical trials, and the fusion type and structure require further study to determine prognostic impact. These emerging biomarkers represent a new horizon in our understanding of disease risk and will enable future efforts to develop risk-adapted treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,072

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0040,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,122
Tête enseignante GPT0,440
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuenpj Precision OncologyMême sujetSarcoma Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207