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Enregistrement W4296378996 · doi:10.1016/j.jbc.2022.102512

Cooperative assembly of filopodia by the formin FMNL2 and I-BAR domain protein IRTKS

2022· article· en· W4296378996 sur OpenAlexafffund
Sarah Fox, Amanda Tran, Laura Trinkle‐Mulcahy, John W. Copeland

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCancer Research SocietyUniversity of Ottawa
Mots-clésFilopodiaForminsCell biologyDomain (mathematical analysis)BiologyChemistryActinBiochemistryActin cytoskeletonCytoskeletonMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Filopodia are long finger-like actin-based structures that project out from the plasma membrane as cells navigate and explore their extracellular environment. The initiation of filopodia formation requires release of tension at the plasma membrane followed by the coordinated assembly of long unbranched actin filaments. Filopodia growth is maintained by a tip complex that promotes actin polymerization and protects the growing barbed ends of the actin fibers from capping proteins. Filopodia growth also depends on additional F-actin bundling proteins to stiffen the actin filaments as well as extension of the membrane sheath projecting from the cell periphery. These activities can be provided by a number of actin-binding and membrane-binding proteins including formins such as formin-like 2 (FMNL2) and FMNL3, and Inverse-Bin-Amphiphysin-Rvs (I-BAR) proteins such as IRTKS and IRSp53, but the specific requirement for these proteins in filopodia assembly is not clear. We report here that IRTKS and IRSp53 are FMNL2-binding proteins. Coexpression of FMNL2 with either I-BAR protein promotes cooperative filopodia assembly. We find IRTKS, but not IRSp53, is required for FMNL2-induced filopodia assembly, and FMNL2 and IRTKS are mutually dependent cofactors in this process. Our results suggest that the primary function for FMNL2 during filopodia assembly is binding to the plasma membrane and that regulation of actin dynamics by its formin homology 2 domain is secondary. From these results, we conclude that FMNL2 initiates filopodia assembly via an unexpected novel mechanism, by bending the plasma membrane to recruit IRTKS and thereby nucleate filopodia assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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