Deciphering the genetic structure of the Quebec founder population using genealogies
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Using genealogy to study the demographic history of a population makes it possible to overcome the models and assumptions often used in population genetics. The Quebec founder population is one of the few populations in the World having access to the complete genealogy of the last 400 years. The goal of this paper is to follow the evolution of the Quebec population structure generation per generation from the beginning of European colonization until the present day. To do so, we calculated the kinship coefficients of all ancestors’ pairs in the ascending genealogy of 665 individuals from eight regional and ethnocultural groups per 25-year period. We show that the Quebec population structure appeared in the St. Lawrence valley as early as 1750. At that time, the ancestors of two groups, the Sagueneans and the Acadians from the Gaspé Peninsula, experienced a marked increase in kinship and inbreeding levels which have shaped the contemporary population structure. Interestingly, this structure arose before the colonization of the Saguenay region and at the very beginning of the Gaspé Peninsula settlement. The resulting regional founder effects in these two groups, but also in the other regional groups, led to differences in the present-day identity-by-descent sharing and are directly linked to the number of most recent common ancestors and their genetic contribution to the studied subjects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».