367 Characterization of the Seminal Microbiota in Beef Bulls Subjected to Different Rate of Gains Using 16S Rrna Gene Sequencing and Culturomics
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Increasing evidence supports the existence of a microbial community in bovine semen, and that this seminal microbiota may influence not only the male reproductive health, but also female and offspring health through microbial transfer. In this study, we evaluated seminal microbiota in beef bulls (BW= 503±7.2 kg) fed a common diet to achieve moderate (1.13 kg/d) or high (1.80 kg/d) rates of weight gain. Semen samples were collected at day 0 and day 112 of dietary intervention (n = 19 per group), and post-breeding (n = 6) using electroejaculation and the microbiota assessed using 16S rRNA gene sequencing, quantification of total bacteria by qPCR, and viable bacteria culturing. A complex and dynamic microbiota was detected in the semen, and the community structure changed significantly over the course of the study (R 2 = 0.126, P < 0.001) but remained unaffected by the dietary treatment (P > 0.05). Microbial richness (number of ASVs) increased from d0 (253 ± 12) to d112 (293 ± 14) while diversity (Shannon index) was reduced (P < 0.05). Twenty-seven bacterial phyla were identified across all samples, with Fusobacteriota (36.3%), Bacteroidetes (30.4%), Firmicutes (17.1%) and Actinobacteriota (14.9%) being the most predominant phyla. Total bacterial load declined over time (P < 0.05). Diet had no effect on alpha diversity metrics, microbial composition, or total bacterial concentration (P > 0.05). A total of 364 bacterial isolates were recovered under aerobic (n = 220) and anaerobic (n = 144) culturing conditions. These isolates represented 48 different genera within the Firmicutes (60%), Proteobacteria (25%), Actinobacteria (9%), Bacteroidetes (4%) and Fusobacteriota (2%) phyla. Bacillus, Staphylococcus, Escherichia, Enterococcus and Arthrobacter were the predominant genera. Overall, our results suggest that bovine semen harbors a rich and complex microbiota which changes over time but appears to be resilient to differential gains achieved via common diet.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».