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Enregistrement W4296623197 · doi:10.26434/chemrxiv-2022-j329q

DNA crosslinked alginate hydrogels: Characterization, microparticle development and applications in forensic science

2022· preprint· en· W4296623197 sur OpenAlexaff
Amanda Orr, Paul J. Wilson, Theresa Stotesbury

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensOntario Tech UniversityTrent University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNASelf-healing hydrogelsCovalent bondCharacterization (materials science)Materials scienceAmine gas treatingChemistryChemical engineeringNanotechnologyPolymer chemistryOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA-based hydrogels are attractive materials due to the integration of highly specific DNA sequences that can perform targeted functions for multiple fields. In this work we present a suite of materials with covalently bound ssDNA to an alginate-based hydrogel for targeted forensic applications. These crosslinked materials not only promote a more stable 3D polymeric network, but also achieve localization of functional ssDNA, a more desirable feature compared to previous DNA encapsulated versions. Specifically, dual amine terminated ssDNA (N-DNA-N) of three different concentrations was bound to alginate using carbodiimide chemistry. Rheological characterization showed that each DNA-crosslinked material forms similar structures, but the higher DNA concentration behaved like a dynamic viscoelastic material. FTIR analysis confirmed the formation of amide bonds, indicative of successful crosslinking between the N-DNA-N and alginate. SEM visualization also showed that each material had distinct topographies, where the covalent crosslinked alginate-DNA materials had more ordered particles and networked structures. We also investigated ssDNA with three different amine functionalities to understand the amine reactivity, which revealed that the N-DNA-N attaches primarily from the terminal primary amines on the DNA strands. From this, microparticles (MPs) using the DNA-crosslinked materials were developed, and the particle morphology and sizes were measured. It was determined that MPs made using DNA-crosslinked materials had larger particle diameters compared to the non-DNA controls, which is ideal for the generation of white blood cell (WBC) mimetics in forensic materials. In addition, these MPs could be successfully processed in a relevant forensic scenario through extraction, amplification, and genotyping, demonstrating the functionality of these materials to forensic blood simulants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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