Comparative lipidomics of <i>Pichia pastoris</i> using constitutive promoter reveals lipid diversity and variability at different growth phases
Notice bibliographique
Résumé
Pichia pastoris is an expression platform widely used for foreign protein expression, while it is unknown how the global lipid profiles changed during the cultivation process, which is crucial for fermentation optimization and chassis design. Therefore, this study aimed to reveal the diverse lipid profiles of P. pastoris controlled by constitutive promoter of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene and to unravel their change in the lag, logarithmic, stationary, and death phases, using ultra-performance liquid chromatography/nano-electrospray ionization-tandem mass spectrometry. Two hundred forty lipid species across 11 lipid classes were detected, including various glycerolipids, glycerophospholipids, and sphingolipids. Pichia cells displayed high diversity and variability of lipids in lipid profile, relative intensity, phosphatidylinositol/phosphatidylserine ratio, fatty acid chain length, and unsaturation degree. Notably, increase of unsaturated triacylglycerol level was accompanied by rise of malondialdehyde level under oxidative stress. The increased ceramide with long fatty acid chain could be a key feature at death phase. This work deepened our understanding of the physiology of P. pastoris during cultivation and provided valuable information for further improvement of the P. pastoris expression system.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».