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Enregistrement W4296777908 · doi:10.1093/jxb/erac379

Temperature-induced changes in Arabidopsis Rubisco activity and isoform expression

2022· article· en· W4296777908 sur OpenAlexaff
Amanda P. Cavanagh, Rebecca Slattery, David S. Kubien

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesScience and Engineering Research Council
Mots-clésArabidopsisRuBisCOGene isoformCell biologyBiologyBotanyGene expressionChemistryBiochemistryPhotosynthesisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In many plant species, expression of the nuclear encoded Rubisco small subunit (SSu) varies with environmental changes, but the functional role of any changes in expression remains unclear. In this study, we investigated the impact of differential expression of Rubisco SSu isoforms on carbon assimilation in Arabidopsis. Using plants grown at contrasting temperatures (10 °C and 30 °C), we confirm the previously reported temperature response of the four RbcS genes and extend this to protein expression, finding that warm-grown plants produce Rubisco containing ~65% SSu-B and cold-grown plants produce Rubisco with ~65% SSu-A as a proportion of the total pool of subunits. We find that these changes in isoform concentration are associated with kinetic changes to Rubisco in vitro: warm-grown plants produce a Rubisco having greater CO2 affinity (i.e. higher SC/O and lower KC) but lower kcatCO2 at warm measurement temperatures. Although warm-grown plants produce 38% less Rubisco than cold-grown plants on a leaf area basis, warm-grown plants can maintain similar rates of photosynthesis to cold-grown plants at ambient CO2 and 30 °C, indicating that the carboxylation capacity of warm-grown Rubisco is enhanced at warmer measurement temperatures, and is able to compensate for the lower Rubisco content in warm-grown plants. This association between SSu isoform expression and maintenance of Rubisco activity at high temperature suggests that SSu isoform expression could impact the temperature response of C3 photosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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