Structural Insights into Microbial One-Carbon Metabolic Enzymes Ni–Fe–S-Dependent Carbon Monoxide Dehydrogenases and Acetyl-CoA Synthases
Notice bibliographique
Résumé
High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Ni–Fe–S-dependent carbon monoxide dehydrogenases (CODHs) are enzymes that interconvert CO and CO 2 by using their catalytic Ni–Fe–S C-cluster and their Fe–S B- and D-clusters for electron transfer. CODHs are important in the microbiota of animals such as humans, ruminants, and termites because they can facilitate the use of CO and CO 2 as carbon sources and serve to maintain redox homeostasis. The bifunctional carbon monoxide dehydrogenase/acetyl-CoA synthase (CODH/ACS) is responsible for acetate production via the Wood–Ljungdahl pathway, where acetyl-CoA is assembled from two CO 2 -derived one-carbon units. A Ni–Fe–S A-cluster is key to this chemistry. Whereas acetogens use the A- and C-clusters of CODH/ACS to produce acetate from CO 2, methanogens use A- and C-clusters of an acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex (ACDS) to break down acetate en route to CO 2 and methane production. Here we review some of the recent advances in understanding the structure and mechanism of CODHs, CODH/ACSs, and ACDSs, their unusual metallocofactors, and their unique metabolic roles in the human gut and elsewhere.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».