Lipidomics Based Microbial Ecology Snapshot of Ophiolitic Rocks
Notice bibliographique
Résumé
Energy from active serpentinization processes potentially fuelled the origin of life on Earth, thus, if serpentinite-impacted sites facilitate microbial habitability, it is important to understand the source and retention of biological signatures in serpentine rocks. Investigating biological signatures in terrestrial analogues of serpentinite-impacted environments is also essential for interpreting molecular signature preservation on extra-terrestrial bodies. To expand knowledge on the types of biological signatures directly derived from living microorganisms (intact polar lipids, IPLs), and both living and dead microorganisms (core lipids), mass spectrometry analysis was performed on Chimaera serpentinite rocks from Antalya Province, Turkey. Brucite rocks were dominated by IPLs from fungal, eukaryotic origin but in contrast, travertine samples had IPL profiles consistent with a mixed fungal, archaeal and bacterial community. The abundance and diversity of archaeal IPLs was significantly higher in the travertine compared to the brucite, and the abundance of archaeal IPLs inside the travertine rock was highest. Archaeal specific core lipids identified inside the brucite rock were not observed as IPL counterparts, suggesting the presence of a non-viable or fossil archaeal community. Comparing IPL profiles with core lipids can discriminate between living microbial communities, necromass, and fossils to combine as a promising molecular tool for identification and interpretation of bio-signatures in serpentinite-impacted sites. Continuing survey of serpentinization samples on Earth can act as analogue environments and provide valuable insight into microbial habitability on Mars and other planetary objects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».