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Enregistrement W4297010877 · doi:10.5194/epsc2022-952

Lipidomics Based Microbial Ecology Snapshot of Ophiolitic Rocks

2022· preprint· en· W4297010877 sur OpenAlexaff
Alexandra Zetterlind, Jayne E. Rattray, Rienk H. Smittenberg, Christian Potiszil, I. L. ten Kate, Anna Neubeck

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExtremophileAstrobiologyBruciteGeomicrobiologyArchaeaLife on MarsMicroorganismMicrobial population biologyHalophileGeologyEcologyChemistryGeochemistryBiologyEarth scienceMars Exploration ProgramPaleontologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Energy from active serpentinization processes potentially fuelled the origin of life on Earth, thus, if serpentinite-impacted sites facilitate microbial habitability, it is important to understand the source and retention of biological signatures in serpentine rocks. Investigating biological signatures in terrestrial analogues of serpentinite-impacted environments is also essential for interpreting molecular signature preservation on extra-terrestrial bodies. To expand knowledge on the types of biological signatures directly derived from living microorganisms (intact polar lipids, IPLs), and both living and dead microorganisms (core lipids), mass spectrometry analysis was performed on Chimaera serpentinite rocks from Antalya Province, Turkey. Brucite rocks were dominated by IPLs from fungal, eukaryotic origin but in contrast, travertine samples had IPL profiles consistent with a mixed fungal, archaeal and bacterial community. The abundance and diversity of archaeal IPLs was significantly higher in the travertine compared to the brucite, and the abundance of archaeal IPLs inside the travertine rock was highest. Archaeal specific core lipids identified inside the brucite rock were not observed as IPL counterparts, suggesting the presence of a non-viable or fossil archaeal community. Comparing IPL profiles with core lipids can discriminate between living microbial communities, necromass, and fossils to combine as a promising molecular tool for identification and interpretation of bio-signatures in serpentinite-impacted sites. Continuing survey of serpentinization samples on Earth can act as analogue environments and provide valuable insight into microbial habitability on Mars and other planetary objects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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