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Enregistrement W4297018173 · doi:10.1038/s41467-022-33322-9

Live imaging and conditional disruption of native PCP activity using endogenously tagged zebrafish sfGFP-Vangl2

2022· article· en· W4297018173 sur OpenAlexafffund
Maria Jussila, Curtis W. Boswell, Nigel Griffiths, Patrick G. Pumputis, Brian Ciruna

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesSigrid Juséliuksen SäätiöCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenGovernment of Canada
Mots-clésZebrafishCell biologyBiologyGreen fluorescent proteinCell polarityPolarity (international relations)CRISPREmbryonic stem cellLive cell imagingCiliumWnt signaling pathwayCas9CellEffectorComputational biologyGeneGeneticsSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tissue-wide coordination of polarized cytoskeletal organization and cell behaviour, critical for normal development, is controlled by asymmetric membrane localization of non-canonical Wnt/planar cell polarity (PCP) signalling components. Understanding the dynamic regulation of PCP thus requires visualization of these polarity proteins in vivo. Here we utilize CRISPR/Cas9 genome editing to introduce a fluorescent reporter onto the core PCP component, Vangl2, in zebrafish. Through live imaging of endogenous sfGFP-Vangl2 expression, we report on the authentic regulation of vertebrate PCP during embryogenesis. Furthermore, we couple sfGFP-Vangl2 with conditional zGrad GFP-nanobody degradation methodologies to interrogate tissue-specific functions for PCP. Remarkably, loss of Vangl2 in foxj1a-positive cell lineages causes ependymal cell cilia and Reissner fiber formation defects as well as idiopathic-like scoliosis. Together, our studies provide crucial insights into the establishment and maintenance of vertebrate PCP and create a powerful experimental paradigm for investigating post-embryonic and tissue-specific functions for Vangl2 in development and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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