The unusual convergence of steroid catabolic pathways in <i>Mycobacterium abscessus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium abscessus , an opportunistic pathogen responsible for pulmonary infections, contains genes predicted to encode two steroid catabolic pathways: a cholesterol catabolic pathway similar to that of Mycobacterium tuberculosis and a 4-androstenedione (4-AD) catabolic pathway. Consistent with this prediction, M. abscessus grew on both steroids. In contrast to M. tuberculosis , Rhodococcus jostii RHA1, and other Actinobacteria, the cholesterol and 4-AD catabolic gene clusters of the M. abscessus complex lack genes encoding HsaD, the meta -cleavage product (MCP) hydrolase. However, M. abscessus ATCC 19977 harbors two hsaD homologs elsewhere in its genome. Only one of the encoded enzymes detectably transformed steroid metabolites. Among tested substrates, HsaD Mab and HsaD Mtb of M. tuberculosis had highest substrate specificities for MCPs with partially degraded side chains thioesterified with coenzyme A ( k cat / K M = 1.9 × 10 4 and 5.7 × 10 3 mM −1 s −1 , respectively). Consistent with a dual role in cholesterol and 4-AD catabolism, HsaD Mab also transformed nonthioesterified substrates efficiently, and a Δ hsaD mutant of M. abscessus grew on neither steroid. Interestingly, both steroids prevented growth of the mutant on acetate. The Δ hsaD mutant of M. abscessus excreted cholesterol metabolites with a fully degraded side chain, while the corresponding RHA1 mutant excreted metabolites with partially degraded side chains. Finally, the Δ hsaD mutant was not viable in macrophages. Overall, our data establish that the cholesterol and 4-AD catabolic pathways of M. abscessus are unique in that they converge upstream of where this occurs in characterized steroid-catabolizing bacteria. The data further indicate that cholesterol is a substrate for intracellular bacteria and that cholesterol-dependent toxicity is not strictly dependent on coenzyme A sequestration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».