Neurodegeneration and humoral response proteins in cerebrospinal fluid associate with pediatric-onset multiple sclerosis and not monophasic demyelinating syndromes in childhood
Notice bibliographique
Résumé
Background: Pediatric-onset multiple sclerosis (POMS) represents the earliest stage of disease pathogenesis. Investigating the cerebrospinal fluid (CSF) proteome in POMS may provide novel insights into early MS processes. Objective: To analyze CSF obtained from children at time of initial central nervous system (CNS) acquired demyelinating syndrome (ADS), to compare CSF proteome of those subsequently ascertained as having POMS versus monophasic acquired demyelinating syndrome (mADS). Methods: Patients were selected from two prospective pediatric ADS studies. Liquid chromatography–mass spectrometry (LC-MS) was performed in a Dutch discovery cohort (POMS n = 28; mADS n = 39). Parallel reaction monitoring–mass spectrometry (PRM-MS) was performed on selected proteins more abundant in POMS in a combined Dutch and Canadian validation cohort (POMS n = 48; mADS n = 106). Results: Discovery identified 5580 peptides belonging to 576 proteins; 58 proteins were differentially abundant with ⩾2 peptides between POMS and mADS, of which 28 more abundant in POMS. Fourteen had increased abundance in POMS with ⩾8 unique peptides. Five selected proteins were all confirmed within validation. Adjusted for age, 2 out of 5 proteins remained more abundant in POMS, that is, Carboxypeptidase E (CPE) and Semaphorin-7A (SEMA7A). Conclusion: This exploratory study identified several CSF proteins associated with POMS and not mADS, potentially reflecting neurodegeneration, compensatory neuroprotection, and humoral response in POMS. The proteins associated with POMS highly correlated with age at CSF sampling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».