TP53 Alterations Are Associated With Poor Survival in Patients With Primary Mediastinal Nonseminoma Germ Cell Tumors
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Primary mediastinal nonseminoma germ cell tumors (PMNSGCT) are a subgroup of nonseminoma germ cell tumors (GCT) with poor prognosis. In this study, PMNSGCT-specific genomic landscape was analyzed and correlated with clinical outcomes. METHODS: DNA was extracted and sequenced from 28 archival tumor tissue of patients with mediastinal GCT (3 seminoma and 25 nonseminoma). Overall survival (OS) and association with gene alterations were estimated using the Kaplan-Meier and univariate Cox regression methods. RESULTS: Three patients (11%) had a karyotype XXY, 17/28 (61%) tumor samples presented chromosome 12p amplification. Somatic mutations were detected in 19/28 (68%) samples. The most frequently mutated genes were: TP53 (13/28; 46%), KIT (5/28; 18%), and KRAS (5/28; 18%). Deleterious TP53 alterations were associated with significantly reduced overall survival (HR: 7.16; P = .012). CONCLUSIONS: TP53 alterations are common in PMNSGCT and are associated with reduced overall survival, potentially underlying the poor sensitivity to chemotherapy observed in these patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».