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Enregistrement W4297265644 · doi:10.1139/cjm-2022-0139

Correlation between <i>SAP2</i> and <i>CAP1</i> in clinical strains of <i>Candida albicans</i> at planktonic and biofilm states

2022· article· en· W4297265644 sur OpenAlexvenueno aff
Wenli Feng, H. J. Yang, Yan Ma, Yinglu Liu, Rong Yin, Zusha Qiao, Ying Ji

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmBiologyCandida albicansMicrobiologyMissense mutationCorpus albicansDownregulation and upregulationGeneGeneticsMutationBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study aimed to explore the influences of SAP2 and CAP1 on itraconazole (ITR) resistance of Candida albicans at different states. A total of 10 ITR-resistant strains and 10 ITR-sensitive strains were used for SAP2 sequencing and CAP1 sequencing. SAP2 sequencing showed no missense mutation, and three synonymous mutations. CAP1 gene sequencing identified two missense mutations M140I (8) and K191Q (4), and 14 synonymous mutations G201A (1), A246C (5), C282T (6), G288A (6), C321T (7), A399C (16), C432T (16), C465T (11), G552A (16), G669T (1), G672A (1), G681T (2), T783C (1), and T819A (2). The biofilm formation capacity of resistant C. albicans strains, including the CAP1∆/∆ strain, was stronger. Afterward, real-time quantitative PCR was used to analyze the expression of SAP2 and CAP1. Compared with the sensitive strains, SAP2 and CAP1 expressions were both significantly upregulated in resistant strains at planktonic and biofilm states ( P < 0.05). Compared with the strains at planktonic state, SAP2 was significantly upregulated, while CAP1 was significantly downregulated at biofilm states ( P < 0.05). Additionally, SAP2 expression in the CAP1 knocked down strain of C. albicans was significantly upregulated, and SAP2 expression was evidently downregulated in the CAP1∆/∆ strain at biofilm states compared with that at planktonic states ( P < 0.05). Loss of CAP1 can increase SAP2 level and may influence the biofilm formation of C. albicans, thus increasing ITR resistance of C. albicans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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