ReproVIP: Enhancing Reproducibility of Scientific Results in Medical Imaging
Notice bibliographique
Résumé
Background : VIP (the Virtual Imaging Platform) is a web portal for medical imaging (MI) data analysis. By leveraging computational and storage resources from the EGI e-infrastructure, VIP provides MI researchers with end-user services to run MI applications on this large-scale computing infrastructure. Research Issue : Medical imaging is facing a reproducibility crisis: the increasing complexity of current data processing methods weakens our ability to produce the same results twice, by applying the same treatments to the same sets of inputs. Beyond the trivial influence of the data exploration process on any scientific result, there is mounting evidence that computing environments (e.g., library calls, OS kernels, hardware infrastructures) also play a significant role by adding numerical uncertainty. Relying on distributed computing resources, the VIP platform is highly concerned by potential versatilities in its digital outcomes. Project Outline : The ReproVIP project addresses this reproducibility issue at every level of data analysis, from the exploration process to the computing environment. It is structured around two complementary goals: (i) evaluate the uncertainty of digital outcomes after EGI-based distributed computing, and (ii) enhance the numerical reproducibility of scientific results obtained through the VIP platform.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,069 | 0,192 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,005 |
| Communication savante | 0,011 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,009 | 0,021 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».