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Enregistrement W4297458622 · doi:10.1002/yea.3816

Da Vinci's yeast: <i>Blastobotrys davincii</i> f.a., sp. nov

2022· article· en· W4297458622 sur OpenAlexafffund
Cobus M. Visagie, Teun Boekhout, Bart Theelen, Jan Dijksterhuis, Neriman Yılmaz, Keith A. Seifert

Notice bibliographique

RevueYeast · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensCarleton UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesForestry and Agricultural Biotechnology Institute, University of PretoriaAgriculture and Agri-Food CanadaAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésBiologyHolotypeCladeGenusPhylogenetic treeRange (aeronautics)Species descriptionZoologyTaxonomy (biology)GeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A new species of the yeast genus Blastobotrys was discovered during a worldwide survey of culturable xerophilic fungi in house dust. Several culture-dependent and independent studies from around the world detected the same species from a wide range of substrates including indoor air, cave wall paintings, bats, mummies, and the iconic self-portrait of Leonardo da Vinci from ca 1512. However, none of these studies identified their strains, clones, or OTUs as Blastobotrys. We introduce the new species as Blastobotrys davincii f.a., sp. nov. (holotype CBS H-24879) and delineate it from other species using morphological, phylogenetic, and physiological characters. The new species of asexually (anamorphic) budding yeast is classified in Trichomonascaceae and forms a clade along with its associated sexual state genus Trichomonascus. Despite the decade-old requirement to use a single generic name for fungi, both names are still used. Selection of the preferred name awaits a formal nomenclatural proposal. We present arguments for adopting Blastobotrys over Trichomonascus and introduce four new combinations as Blastobotrys allociferrii (≡ Candida allociferrii), B. fungorum (≡ Sporothrix fungorum), B. mucifer (≡ Candida mucifera), and Blastobotrys vanleenenianus (≡ Trichomonascus vanleenenianus). We provide a nomenclatural review and an accepted species list for the 37 accepted species in the Blastobotrys/Trichomonascus clade. Finally, we discuss the identity of the DNA clones detected on the da Vinci portrait, and the importance of using appropriate media to isolate xerophilic or halophilic fungi.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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