MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4297475416 · doi:10.3389/fdata.2022.793606

Application of multiple testing procedures for identifying relevant comorbidities, from a large set, in traumatic brain injury for research applications utilizing big health-administrative data

2022· article· en· W4297475416 sur OpenAlexafffund
Sayantee Jana, Mitchell Sutton, Tatyana Mollayeva, Vincy Chan, Angela Colantonio, Michael Escobar

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Big Data · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraumatic Brain Injury Research
Établissements canadiensInstitute for Clinical Evaluative SciencesOntario Tech UniversityPublic Health OntarioToronto Rehabilitation InstituteUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeToronto Rehabilitation InstituteNational Institutes of HealthAlzheimer's Association
Mots-clésBig dataSet (abstract data type)Traumatic brain injuryData scienceData setComputer sciencePsychologyMedicineMedical emergencyData miningPsychiatryArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Multiple testing procedures (MTP) are gaining increasing popularity in various fields of biostatistics, especially in statistical genetics. However, in injury surveillance research utilizing the growing amount and complexity of health-administrative data encoded in the International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems 10th Revision (ICD-10), few studies involve MTP and discuss their applications and challenges. Objective: We aimed to apply MTP in the population-wide context of comorbidity preceding traumatic brain injury (TBI), one of the most disabling injuries, to find a subset of comorbidity that can be targeted in primary injury prevention. Methods: In total, 2,600 ICD-10 codes were used to assess the associations between TBI and comorbidity, with 235,003 TBI patients, on a matched data set of patients without TBI. McNemar tests were conducted on each 2,600 ICD-10 code, and appropriate multiple testing adjustments were applied using the Benjamini-Yekutieli procedure. To study the magnitude and direction of associations, odds ratios with 95% confidence intervals were constructed. Results: Benjamini-Yekutieli procedure captured 684 ICD-10 codes, out of 2,600, as codes positively associated with a TBI event, reducing the effective number of codes for subsequent analysis and comprehension. Conclusion: Our results illustrate the utility of MTP for data mining and dimension reduction in TBI research utilizing big health-administrative data to support injury surveillance research and generate ideas for injury prevention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,081
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,316
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,919
Score d'incertitude au seuil0,427

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0810,316
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,665
Tête enseignante GPT0,519
Écart entre enseignants0,146 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Big DataMême sujetTraumatic Brain Injury ResearchTravaux en français237 207