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Enregistrement W4297789999 · doi:10.1101/2022.08.31.506132

Membrane cholesterol regulates inhibition and substrate transport by the glycine transporter, GlyT2

2022· preprint· en· W4297789999 sur OpenAlexaff
Zachary J. Frangos, Katie A. Wilson, Heather M. Aitken, Ryan Cantwell Chater, Robert J. Vandenberg, Megan L. O’Mara

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilNational Cancer InstituteMedical Research CouncilAustralian GovernmentNational Computational Infrastructure
Mots-clésAllosteric regulationCholesterolBiochemistryChemistryTransporterNeurotransmitter transporterGlycine receptorGlycineBiophysicsBiologyEnzymeAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Membrane cholesterol binds to and modulates the function of the specific SLC6 transporters. Here we investigate how cholesterol binds to and modulates the rate of glycine transport by the SLC6 glycine transporter GlyT2, and how this impacts lipid inhibition of GlyT2. Bioactive lipid inhibitors of GlyT2 are analgesics that bind to the lipid allosteric site of the outward facing GlyT2 conformation that is accessible from the extracellular solution. Using molecular dynamics simulations, mutagenesis and cholesterol depletion experiments, we show that bioactive lipid inhibition of glycine transport is modulated by the recruitment of membrane cholesterol to a cholesterol binding site formed by transmembrane helices 1, 5 and 7. Recruitment involves cholesterol flipping from its membrane orientation, and insertion of the 3’ hydroxyl group into the cholesterol binding cavity to interact with the base of the lipid allosteric site and the bound inhibitor. The recruitment of membrane cholesterol by allosteric GlyT2 inhibitors is a potential avenue for the development of high-potency, specific pain analgesics and could provide alternative therapeutics that target GlyT2 and other SLC6 neurotransmitter transporters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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