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Enregistrement W4297989868 · doi:10.1038/s41598-022-20786-4

p38MAPK guards the integrity of endosomal compartments through regulating necrotic death

2022· article· en· W4297989868 sur OpenAlexfundno aff
Jia Yao, Svetlana Atasheva, Randall Toy, Emmeline L. Blanchard, Philip J. Santangelo, Krishnendu Roy, Edward S. Mocarski, Dmitry M. Shayakhmetov

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOffice of Research Infrastructure Programs, National Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesEmory UniversityUniversity of TorontoNational Cancer InstituteYerkes National Primate Research Center, Emory UniversityYale UniversityNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésRIPK1PyroptosisNecroptosisCell biologyInnate immune systemProgrammed cell deathEndosomeBiologyPattern recognition receptorCaspaseImmune systemInflammasomeSignal transductionProtein kinase ANecrosisReceptorKinaseApoptosisImmunologyIntracellularBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogens trigger activation of sensors of the innate immune system that initiate molecular signaling enabling appropriate host defense programs. Although recognition of pathogen-specific moieties or PAMPs by specialized receptors of the immune system is well defined for a great number of pathogens, the mechanisms of sensing of pathogen-induced functional perturbations to the host cell remain poorly understood. Here we show that the disruption of endosomal compartments in macrophages by a bacterium or fully synthetic nanoparticles activates stress-response p38MAPK kinase, which triggers execution of cell death of a necrotic type. p38MAPK-mediated necrosis occurs in cells with a compound homozygous deletion of pyroptosis-inducing caspases-1 and -11, apoptotic caspase-8, and necroptosis-inducing receptor-interacting protein kinase-3 (RIPK3), indicating that all of these principal cell death mediators are dispensable for p38MAPK-induced necrosis in response to endosome rupture. p38MAPK-mediated necrosis is suppressed by the receptor-interacting protein kinase 1, RIPK1, and degradation of RIPK1 sensitizes macrophages to necrotic death. Since pathogen-induced cell death of necrotic types is implicated in host defense against infection, our results indicate that functional perturbations in host cells are sensed as a component of the innate immune system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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