Covalent Modification of Bromodomain Proteins by Peptides Containing a DNA Damage‐Induced, Histone Post‐Translational Modification
Notice bibliographique
Résumé
Abstract An electrophilic 5‐methylene‐2‐pyrrolone modification (K MP ) is produced at lysine residues of histone proteins in nucleosome core particles upon reaction with a commonly formed DNA lesion (C4‐AP). The nonenzymatic K MP modification is also generated in the histones of HeLa cells treated with the antitumor agent, bleomycin that oxidizes DNA and forms C4‐AP. This nonenzymatic covalent histone modification has the same charge as the N ‐acetyllysine (K Ac ) modification but is more electrophilic. In this study we show that K MP ‐containing histone peptides are recognized by, and covalently modify bromodomain proteins that are K Ac readers. Distinct selectivity preferences for covalent bromodomain modification are observed following incubation with K MP ‐containing peptides of different sequence. MS/MS analysis of 3 covalently modified bromodomain proteins confirmed that Cys adduction was selective. The modified Cys was not always proximal to the K Ac binding site, indicating that K MP ‐containing peptide interaction with bromodomain protein is distinct from the former. Analysis of protein adduction yields as a function of bromodomain pH at which the protein charge is zero (pI) or cysteine solvent accessible surface area are also consistent with non‐promiscuous interaction between the proteins and electrophilic peptides. These data suggest that intracellular formation of K MP could affect cellular function and viability by modifying proteins that regulate genetic expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».