MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4298002983 · doi:10.3390/diagnostics12102360

Liquid Biopsy: A Multi-Parametric Analysis of Mutation Status, Circulating Tumor Cells and Inflammatory Markers in EGFR-Mutated NSCLC

2022· article· en· W4298002983 sur OpenAlexfundno aff
Martin P. Barr, Anne‐Marie Baird, Sophia R. Halliday, Petra Martin, Emma H. Allott, J.J. Phelan, Greg Korpanty, Linda Coate, Cathal Ó’Brien, Steven G. Gray, Jane Sze Yin Sui, Brian Hayes, Sinéad Cuffe, Stephen P. Finn

Notice bibliographique

RevueDiagnostics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesQueen's UniversityQueen's University Belfast
Mots-clésT790MMedicineLiquid biopsyEpidermal growth factor receptorInternal medicineLung cancerOncologyBiopsyPathologyCancerCancer researchGefitinib

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The liquid biopsy has the potential to improve patient care in the diagnostic and therapeutic setting in non-small cell lung cancer (NSCLC). Consented patients with epidermal growth factor receptor (EGFR) positive disease (n = 21) were stratified into two cohorts: those currently receiving EGFR tyrosine kinase inhibitor (TKI) therapy (n = 9) and newly diagnosed EGFR TKI treatment-naïve patients (n = 12). Plasma genotyping of cell-free DNA was carried out using the FDA-approved cobas® EGFR mutation test v2 and compared to next generation sequencing (NGS) cfDNA panels. Circulating tumor cell (CTC) numbers were correlated with treatment response and EGFR exon 20 p.T790M. The prognostic significance of the neutrophil to lymphocyte ratio (NLR) and lactate dehydrogenase (LDH) was also investigated. Patients in cohort 1 with an EGFR exon 20 p.T790M mutation progressed more rapidly than those with an EGFR sensitizing mutation, while patients in cohort 2 had a significantly longer progression-free survival (p = 0.04). EGFR exon 20 p.T790M was detected by liquid biopsy prior to disease progression indicated by computed tomography (CT) imaging. The cobas® EGFR mutation test detected a significantly greater number of exon 20 p.T790M mutations (p = 0.05). High NLR and derived neutrophil to lymphocyte ratio (dNLR) were associated with shorter time to progression and worse survival outcomes (p < 0.05). High LDH levels were significantly associated with shorter time to disease progression (p = 0.03). These data support the use of liquid biopsy for monitoring EGFR mutations and inflammatory markers as prognostic indicators in NSCLC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDiagnosticsMême sujetLung Cancer Treatments and MutationsTravaux en français237 207