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Enregistrement W4298080306 · doi:10.1101/2022.09.28.509973

<i>kcna1a</i> mutant zebrafish as a model of episodic ataxia type 1 and epilepsy

2022· preprint· en· W4298080306 sur OpenAlexafffund
Deepika Dogra, Paola L. Meza‐Santoscoy, Renata Rehak, Cristiane Lucia Rodriguez de la Hoz, Cezar Gavrilovici, Kingsley Ibhazehiebo, Jong M. Rho, Deborah M. Kurrasch

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesFondation Brain CanadaCreighton University
Mots-clésZebrafishEpilepsyAtaxiaNeuroscienceBiologyCarbamazepineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Objective KCNA1 mutations are associated with a rare neurological movement disorder known as episodic ataxia type 1 (EA1), with epilepsy as a common comorbidity. Current medications only provide partial relief to ataxia and/or seizures, making new drugs needed. Here, we investigate the utility of zebrafish kcna1a −/− as a model of EA1 with epilepsy by characterizing its phenotype and comparing the efficacy of the first-line therapy carbamazepine in kcna1a −/− zebrafish to Kcna1 −/− rodents. Methods We used CRISPR/Cas9 mutagenesis to introduce a mutation in the sixth segment of the zebrafish Kcna1 protein. Behavioral and electrophysiological assays were performed on kcna1a −/− larvae to assess ataxia- and epilepsy-related phenotypes. We also carried out real-time qPCRs to measure the transcript levels of brain hyperexcitability markers and bioenergetic profiling of kcna1a −/− larvae to evaluate their metabolic health. Carbamazepine efficacy was tested using behavioral assessments in kcna1a −/− zebrafish and seizure frequency in Kcna1 −/− mice. Results kcna1a −/− zebrafish showed uncoordinated movements and locomotor deficits. The mutants also exhibited impaired startle responses when exposed to light-dark flashes and acoustic stimulation. Extracellular field recordings and upregulated fosab transcript levels showed hyperexcitability of the kcna1a −/− brain. Further, vglut2a and gad1b transcript levels were altered, indicative of neuronal excitatory/inhibitory imbalance in the kcna1a −/− brain. Metabolic health was also compromised in kcna1a −/− as seen by a significant reduction in measures of cellular respiration. Notably, carbamazepine reduced the impaired startle response in kcna1a −/− zebrafish but had no effect on the seizure frequency in Kcna1 −/− mice, suggesting that this EA1 zebrafish model might better translate to human efficacy compared to rodents. Significance We conclude that zebrafish kcna1a −/− larvae show ataxia and epilepsy-related phenotypes and that they are responsive to carbamazepine treatment, consistent with EA1 patients. This study supports the notion that these zebrafish disease models can be useful for drug screening as well as studying the underlying disease biology. KEY POINTS Zebrafish kcna1a −/− larvae display dynamic behavioral changes, along with ataxia-like uncoordinated movements and brain hyperexcitability kcna1a −/− larvae have dysfunctional neuronal excitatory/inhibitory balance and perturbed metabolic health Similar to its effectiveness in patients, carbamazepine treatment improves behavioral deficits in kcna1a −/− larvae

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
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