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Enregistrement W4298124603 · doi:10.1093/g3journal/jkac224

The future of fungi: threats and opportunities

2022· article· en· W4298124603 sur OpenAlexafffundabout
Nicola T. Case, Judith Berman, David S. Blehert, Robert A. Cramer, Christina A. Cuomo, Cameron R. Currie, Iuliana V. Ene, Matthew C. Fisher, Lillian K. Fritz‐Laylin, Aleeza C. Gerstein, N. Louise Glass, Neil A. R. Gow, Sarah J. Gurr, Chris Todd Hittinger, Tobias M. Hohl, Iliyan D. Iliev, Timothy Y. James, Hailing Jin, Bruce S. Klein, James W. Kronstad, Jeffrey M. Lorch, Victoria McGovern, Aaron P. Mitchell, Julia A. Segre, Rebecca S. Shapiro, Donald C. Sheppard, Anita Sil, Jason Stajich, Eva E Stukenbrock, John W. Taylor, Dawn Thompson, Gerard D. Wright, Joseph Heitman, Leah E. Cowen

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensMcMaster UniversityMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaUniversity of GuelphCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of ManitobaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDivision of Graduate EducationNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNatural Environment Research CouncilGreat Lakes Bioenergy Research CenterOffice of ScienceNational Institutes of HealthNational Institute of Food and AgricultureSight Research UKWellcome TrustCanadian Institute for Advanced ResearchMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterCanadian Institutes of Health ResearchNational Science FoundationNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilRichard and Susan Smith Family FoundationU.S. Department of EnergyGordon and Betty Moore FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyAgricultureFood securityHuman healthEnvironmental planningBiotechnologyEnvironmental resource managementEcologyBusinessEnvironmental healthGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fungal kingdom represents an extraordinary diversity of organisms with profound impacts across animal, plant, and ecosystem health. Fungi simultaneously support life, by forming beneficial symbioses with plants and producing life-saving medicines, and bring death, by causing devastating diseases in humans, plants, and animals. With climate change, increased antimicrobial resistance, global trade, environmental degradation, and novel viruses altering the impact of fungi on health and disease, developing new approaches is now more crucial than ever to combat the threats posed by fungi and to harness their extraordinary potential for applications in human health, food supply, and environmental remediation. To address this aim, the Canadian Institute for Advanced Research (CIFAR) and the Burroughs Wellcome Fund convened a workshop to unite leading experts on fungal biology from academia and industry to strategize innovative solutions to global challenges and fungal threats. This report provides recommendations to accelerate fungal research and highlights the major research advances and ideas discussed at the meeting pertaining to 5 major topics: (1) Connections between fungi and climate change and ways to avert climate catastrophe; (2) Fungal threats to humans and ways to mitigate them; (3) Fungal threats to agriculture and food security and approaches to ensure a robust global food supply; (4) Fungal threats to animals and approaches to avoid species collapse and extinction; and (5) Opportunities presented by the fungal kingdom, including novel medicines and enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Synthèse
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objetlow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Synthèse
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Autre devishigh
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0070,011
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0060,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeSans objet · Autre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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