A screen for downstream effectors of Neurogenin2 in the embryonic neocortex
Notice bibliographique
Résumé
Neurogenin (Ngn) 1 and Ngn2 encode basic-helix-loop-helix transcription factors expressed in the developing neocortex. Like other proneural genes, Ngns participate in the specification of neural fates and neuronal identities, but downstream effectors remain poorly defined. We set out to identify Ngn2 effectors in the cortex using a subtractive hybridization screen and identified several regionally expressed genes that were misregulated in Ngn2 and Ngn1; Ngn2 mutants. Included were genes down-regulated in germinal zone progenitors (e.g., Nlgn1, Unc5H4, and Dcc) and in postmitotic neurons in the cortical plate (e.g., Bhlhb5 and NFIB) and subplate (e.g., Mef2c, srGAP3, and protocadherin 9). Further analysis revealed that Ngn2 mutant subplate neurons were misspecified and that thalamocortical afferents (TCAs) that normally target this layer instead inappropriately projected towards the germinal zone. Strikingly, EphA5 and Sema3c, which encode repulsive guidance cues, were down-regulated in the Ngn2 and Ngn1; Ngn2 mutant germinal zones, providing a possible molecular basis for axonal targeting defects. Thus, we identified several new components of the differentiation cascade(s) activated downstream of Ngn1 and Ngn2 and provided novel insights into a new developmental process controlled by these proneural genes. Further analysis of the genes isolated in our screen should provide a fertile basis for understanding the molecular mechanisms underlying corticogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».