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Enregistrement W4298394297 · doi:10.1186/s13053-022-00241-1

Colorectal cancer incidences in Lynch syndrome: a comparison of results from the prospective lynch syndrome database and the international mismatch repair consortium

2022· article· en· W4298394297 sur OpenAlexaff
Pål Møller, Toni T. Seppälä, James G. Dowty, Saskia Haupt, Mev Dominguez–Valentin, Lone Sunde, Inge Bernstein, Christoph Engel, Stefan Aretz, Maartje Nielsen, Gabriel Capellá, D. Gareth Evans, John Burn, Elke Holinski‐Feder, Lucio Bertario, Bernardo Bonanni, Annika Lindblom, Zohar Levi, Finlay Macrae, Ingrid Winship, John‐Paul Plazzer, Rolf H. Sijmons, Luigi Laghi, Adriana Della Valle, Karl Heinimann, Elizabeth Half, Francisco Lopez-Koestner, Karin Alvarez-Valenzuela, Rodney J. Scott, Lior H. Katz, Ido Laish, E Vainer, Carlos Vaccaro, Dirce Maria Carraro, Nathan Gluck, Naim Abu‐Freha, Áine Stakelum, Rory Kennelly, D. C. Winter, Bernard Rossi, Marc S. Greenblatt, Mábel Bohórquez, Harsh Sheth, Maria Grazia Tibiletti, Leonardo S. Lino‐Silva, Karoline Horisberger, Carmen Portenkirchner, Ivana do Nascimento, Norma Rossi, Leandro Apolinário da Silva, Huw Thomas, Attila Zaránd, Jukka‐Pekka Mecklin, Kirsi Pylvänäinen, Laura Renkonen‐Sinisalo, Anna Lepistö, Païvi Peltomäki, Christina Therkildsen, Lars Joachim Lindberg, Ole Thorlacius‐Ussing, Magnus von Knebel Doeberitz, Markus Loeffler, Nils Rahner, Verena Steinke‐Lange, Wolff Schmiegel, Deepak Vangala, Claudia Perne, Robert Hüneburg, Aı́da Falcón de Vargas, Andrew Latchford, Anne‐Marie Gerdes, A Bäckman, Carmen Guillén‐Ponce, Carrie Snyder, Charlotte Kvist Lautrup, David J. Amor, Edenir Inêz Palmero, Elena M. Stoffel, Floor A.M. Duijkers, Michael J. Hall, Heather Hampel, Heinric Williams, Henrik Okkels, Jan Lubiński, Jeanette C. Reece, Joanne Ngeow, José G. Guillem, Julie Arnold, Karin Wadt, Kevin Monahan, Leigha Senter, Lene Juel Rasmussen, Liselotte P. van Hest, Luigi Ricciardiello, Maija R.J. Kohonen‐Corish, Marjolijn J. L. Ligtenberg, Melissa C. Southey, Melyssa Aronson, Mohd Nizam Zahary, N. Jewel Samadder, Nicola Poplawski, Patrick J. Morrison, Paul A. James, Grant Lee, Rakefet Chen‐Shtoyerman, Ravindran Ankathil, Rish K. Pai, Robyn L. Ward, Susan Parry, Tadeusz Dębniak, Thomas John, Thomas van Overeem Hansen, Trinidad Caldés, Tatsuro Yamaguchi, Verónica Barca-Tierno, Pilar Garré, Giulia Martina Cavestro, Jürgen Weitz, Silke Redler, Reinhard Büttner, Vincent Heuveline, John L. Hopper, Aung Ko Win, Noralane M. Lindor, Steven Gallinger, Loı̈c Le Marchand, Polly A. Newcomb, Jane C. Figueiredo, Daniel D. Buchanan, Stephen N. Thibodeau, Sanne W. ten Broeke, Eivind Hovig, Sigve Nakken, Marta Pineda, Núria Dueñas, Joan Brunet, Kate Green, Fiona Lalloo, Katie Newton, Emma J. Crosbie, Miriam Mints, Douglas Tjandra, Florencia Neffa, Patricia Esperón, Revital Kariv, Guy Rosner, Walter Pavicic, Pablo Kalfayan, Giovana Tardin Torrezan, Thiago Bassaneze, Claudia Martin, Gabriela Möslein, Aysel Ahadova, Matthias Kloor, Julian R. Sampson, Mark A. Jenkins

Notice bibliographique

RevueHereditary Cancer in Clinical Practice · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai HospitalSinai Health System
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerManchester Biomedical Research CentreSupport Program for Longyuan Youth and Fundamental Research Funds for the Universities of Gansu ProvinceSigrid Juséliuksen SäätiöCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloEmil Aaltosen SäätiöDeutsche KrebshilfeKreftforeningenConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoMinisterio de Economía y CompetitividadThird Health ProgrammeCancer Council NSWCancer Research UKSuomen Lääketieteen SäätiöAcademy of FinlandEuropean CommissionRelander FoundationCentres de Recerca de CatalunyaParc Geneteg CymruHealth and Care Research WalesJane ja Aatos Erkon SäätiöGeneralitat de CatalunyaNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésLynch syndromeMedicineDNA mismatch repairColorectal cancerInternal medicineCancerOncologyDatabaseGeneral surgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To compare colorectal cancer (CRC) incidences in carriers of pathogenic variants of the MMR genes in the PLSD and IMRC cohorts, of which only the former included mandatory colonoscopy surveillance for all participants. METHODS: CRC incidences were calculated in an intervention group comprising a cohort of confirmed carriers of pathogenic or likely pathogenic variants in mismatch repair genes (path_MMR) followed prospectively by the Prospective Lynch Syndrome Database (PLSD). All had colonoscopy surveillance, with polypectomy when polyps were identified. Comparison was made with a retrospective cohort reported by the International Mismatch Repair Consortium (IMRC). This comprised confirmed and inferred path_MMR carriers who were first- or second-degree relatives of Lynch syndrome probands. RESULTS: In the PLSD, 8,153 subjects had follow-up colonoscopy surveillance for a total of 67,604 years and 578 carriers had CRC diagnosed. Average cumulative incidences of CRC in path_MLH1 carriers at 70 years of age were 52% in males and 41% in females; for path_MSH2 50% and 39%; for path_MSH6 13% and 17% and for path_PMS2 11% and 8%. In contrast, in the IMRC cohort, corresponding cumulative incidences were 40% and 27%; 34% and 23%; 16% and 8% and 7% and 6%. Comparing just the European carriers in the two series gave similar findings. Numbers in the PLSD series did not allow comparisons of carriers from other continents separately. Cumulative incidences at 25 years were < 1% in all retrospective groups. CONCLUSIONS: Prospectively observed CRC incidences (PLSD) in path_MLH1 and path_MSH2 carriers undergoing colonoscopy surveillance and polypectomy were higher than in the retrospective (IMRC) series, and were not reduced in path_MSH6 carriers. These findings were the opposite to those expected. CRC point incidence before 50 years of age was reduced in path_PMS2 carriers subjected to colonoscopy, but not significantly so.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,354 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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