MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4298395336 · doi:10.1101/2022.09.30.509852

Maturation of SARS-CoV-2 Spike-specific memory B cells drives resilience to viral escape

2022· preprint· en· W4298395336 sur OpenAlexfundno aff
Roberta Marzi, Jessica Bassi, Chiara Silacci-Fregni, István Bartha, Francesco Muoio, Katja Culap, Nicole Sprugasci, Gloria Lombardo, Christian Saliba, Elisabetta Cameroni, Antonino Cassotta, Jun Siong Low, Alexandra C. Walls, Matthew McCallum, M. Alejandra Tortorici, John E. Bowen, Exequiel Dellota, Josh R. Dillen, Nadine Czudnochowski, Laura Pertusini, Tatiana Terrot, Valentino Lepori, Maciej Tarkowski, Agostino Riva, Maira Biggiogero, Alessandra Franzetti-Pellanda, Christian Garzoni, Paolo Ferrari, Alessandro Ceschi, Olivier Giannini, Colin Havenar‐Daughton, Amalio Telenti, Ann M. Arvin, Herbert W. Virgin, Federica Sallusto, David Veesler, Antonio Lanzavecchia, Davide Corti, Luca Piccoli

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthHelmut Horten StiftungBurroughs Wellcome FundFast GrantsHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésAvidityAntibodyBiologyVirologyTiterMemory B cellCoronavirusImmunologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)B cellDiseaseMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Memory B cells (MBCs) generate rapid antibody responses upon secondary encounter with a pathogen. Here, we investigated the kinetics, avidity and cross-reactivity of serum antibodies and MBCs in 155 SARS-CoV-2 infected and vaccinated individuals over a 16-month timeframe. SARS-CoV-2-specific MBCs and serum antibodies reached steady-state titers with comparable kinetics in infected and vaccinated individuals. Whereas MBCs of infected individuals targeted both pre- and postfusion Spike (S), most vaccine-elicited MBCs were specific for prefusion S, consistent with the use of prefusion-stabilized S in mRNA vaccines. Furthermore, a large fraction of MBCs recognizing postfusion S cross-reacted with human betacoronaviruses. The avidity of MBC-derived and serum antibodies increased over time resulting in enhanced resilience to viral escape by SARS-CoV-2 variants, including Omicron BA.1 and BA.2 sub-lineages, albeit only partially for BA.4 and BA.5 sublineages. Overall, the maturation of high-affinity and broadly-reactive MBCs provides the basis for effective recall responses to future SARS-CoV-2 variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 Research→Travaux en français237 207→