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Enregistrement W4298414296 · doi:10.17615/p87y-d952

Inherited variation at MC1R and ASIP and association with melanoma-specific survival

2020· article· en· W4298414296 sur OpenAlexfundno aff
Anne Ε. Cust, Irene Orlow, Anne S. Reiner, Roberto Zanetti, Colin B. Begg, Terence Dwyer, Lynn From, Nicholas J. Taylor, Klaus J. Busam, Timothy R. Rebbeck, Marianne Berwick, Nancy E. Thomas, Richard P. Gallagher, Stefano Rosso, Stephen B. Gruber, Kirsten A. White, Peter A. Kanetsky, Hoda Anton‐Culver

Notice bibliographique

RevueeScholarship (California Digital Library) · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of California, IrvineUniversity of North Carolina at Chapel HillNational Institutes of HealthMissouri Department of Health and Senior ServicesMenzies Institute for Medical ResearchUniversity of SydneyUniversity of TasmaniaMichael Smith Health Research BCMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterCancer Council NSWMenzies Research Institute TasmaniaCancer Care OntarioUniversity of PennsylvaniaNational Cancer InstituteState of New Jersey Department of HealthUniversity of Southern California
Mots-clésVariation (astronomy)MelanomaAssociation (psychology)MedicineBiologyGeneticsPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MC1R is a marker of melanoma risk in populations of European ancestry. However, MC1R effects on survival are much less studied. We investigated associations between variation at MC1R and survival in an international, population-based series of single primary melanoma patients enrolled into the GEM study. MC1R genotype data was available for 2,200 participants with a first incident primary melanoma diagnosis. We estimated the association of MC1R genotypes with melanoma-specific survival (i.e. death due to melanoma) and overall survival using Cox proportional hazards modeling, adjusting for established prognostic factors for melanoma. We also conducted stratified analyses by Breslow thickness, tumor site, phenotypic index and age. Additionally, we evaluated haplotypes involving polymorphisms near the ASIP locus for their impacts on survival. Melanoma-specific survival was inversely associated with carriage of MC1R variants in the absence of consensus alleles compared to carriage of at least one consensus allele (HR=0.60; 95%CI: 0.40, 0.90). MC1R results for overall survival were consistent with no association. We did not observe any statistical evidence of heterogeneity of effect estimates in stratified analyses. We observed increased hazard of melanoma-specific death among carriers of the risk haplotype TG near the ASIP locus (HR=1.37; 95%CI: 0.91, 2.04) when compared to carriers of the most common GG haplotype. Similar results were noted for overall survival. Upon examining the ASIP TG/TG diplotype, we observed considerably increased hazard of melanoma-specific death (HR=5.11; 95%CI: 1.88, 13.88) compared to carriers of the most common GG/GG diplotype. Our data suggest improved melanoma-specific survival among carriers of two inherited MC1R variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,566
Score d'incertitude au seuil0,629

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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