Prime editing optimized RTT permits the correction of the c.8713C>T mutation in DMD gene
Notice bibliographique
Résumé
Duchenne muscular dystrophy is a severe debilitating genetic disease caused by different mutations in the DMD gene leading to the absence of dystrophin protein under the sarcolemma. We used CRISPR-Cas9 prime editing technology for correction of the c.8713C>T mutation in the DMD gene and tested different variations of reverse transcription template (RTT) sequences. We increased by 3.8-fold the editing percentage of the target nucleotide located at +13. A modification of the protospacer adjacent motif sequence (located at +6) and a silent mutation (located at +9) were also simultaneously added to the target sequence modification. We observed significant differences in editing efficiency in interconversion of different nucleotides and the distance between the target, the nicking site, and the additional mutations. We achieved 22% modifications in myoblasts of a DMD patient, which led to dystrophin expression detected by western blot in the myotubes that they formed. RTT optimization permitted us to improve the prime editing of a point mutation located at +13 nucleotides from the nick site to restore dystrophin protein. Duchenne muscular dystrophy is a severe debilitating genetic disease caused by different mutations in the DMD gene leading to the absence of dystrophin protein under the sarcolemma. We used CRISPR-Cas9 prime editing technology for correction of the c.8713C>T mutation in the DMD gene and tested different variations of reverse transcription template (RTT) sequences. We increased by 3.8-fold the editing percentage of the target nucleotide located at +13. A modification of the protospacer adjacent motif sequence (located at +6) and a silent mutation (located at +9) were also simultaneously added to the target sequence modification. We observed significant differences in editing efficiency in interconversion of different nucleotides and the distance between the target, the nicking site, and the additional mutations. We achieved 22% modifications in myoblasts of a DMD patient, which led to dystrophin expression detected by western blot in the myotubes that they formed. RTT optimization permitted us to improve the prime editing of a point mutation located at +13 nucleotides from the nick site to restore dystrophin protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».