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Enregistrement W4299543223 · doi:10.17615/0wmw-f324

Group-constrained sparse fMRI connectivity modeling for mild cognitive impairment identification

2020· article· en· W4299543223 sur OpenAlexfundno aff
Chong‐Yaw Wee, Pew‐Thian Yap, Daoqiang Zhang, Lihong Wang, Dinggang Shen

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenentechNational Institutes of HealthUniversity of California, Los AngelesServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationUniversity of California, San DiegoBioClinicaMedpaceBiogenBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyAstraZenecaAmorfix Life SciencesBayer HealthCareMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationPfizerSynarcAlzheimer's Association
Mots-clésIdentification (biology)CognitionFunctional connectivityCognitive impairmentPsychologyCognitive psychologyGroup (periodic table)Computer scienceArtificial intelligenceNeuroscienceBiologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Emergence of advanced network analysis techniques utilizing resting-state functional Magnetic Resonance Imaging (R-fMRI) has enabled a more comprehensive understanding of neurological disorders at a whole-brain level. However, inferring brain connectivity from R-fMRI is a challenging task, particularly when the ultimate goal is to achieve good control-patient classification performance, owing to perplexing noise effects, curse of dimensionality, and inter-subject variability. Incorporating sparsity into connectivity modeling may be a possible solution to partially remedy this problem since most biological networks are intrinsically sparse. Nevertheless, sparsity constraint, when applied at an individual level, will inevitably cause inter-subject variability and hence degrade classification performance. To this end, we formulate the R-fMRI time series of each region-of-interest (ROI) as a linear representation of time series of other ROIs to infer sparse connectivity networks that are topologically identical across individuals. This formulation allows simultaneous selection of a common set of ROIs across subjects so that their linear combination is best in estimating the time series of the considered ROI. Specifically, l1-norm is imposed on each subject to filter out spurious or insignificant connections to produce sparse networks. A group-constraint is hence imposed via multi-task learning using a l2-norm to encourage consistent non-zero connections across subjects. This group-constraint is crucial since the network topology is identical for all subjects while still preserving individual information via different connectivity values. We validated the proposed modeling in mild cognitive impairment (MCI) identification and promising results achieved demonstrate its superiority in disease characterization, particularly greater sensitivity to early stage brain pathologies. The inferred group-constrained sparse network is found to be biologically plausible and is highly associated with the disease-associated anatomical anomalies. Furthermore, our proposed approach achieved similar classification performance when finer atlas was used to parcellate the brain space.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,565
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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